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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001934`

染色体: Chr04 坐标: 31440420-31444948 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001934`
名称	SmilChr04G001934
描述	uncharacterized SmilChr04G001934
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	31440420 - 31444948 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023288`
GeneID	`131023288`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023288`
原始查询	`SmilChr04G001934`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=27.9; qcov=0.401; evalue=6.72e-43; confidence=low
Rice	`Os03g0643433` - identity=27; qcov=0.567; evalue=3.77e-71; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023288

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808818.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057808818.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057808818.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808818.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808818.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:31440430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B61,C53,C82
`Chr4:31440534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr4:31440544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B1,B107,B123,B39,B55
`Chr4:31440544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B107,B123,B39,B55
`Chr4:31440563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,D6
`Chr4:31440568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B8
`Chr4:31440604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr4:31440662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,A9,C21,C53,C54
`Chr4:31440670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:31440751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,A2,A24,C14,C84
`Chr4:31440776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr4:31440805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B24,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808818.1

1071 aa

536

1071

RVT_1

zf-RVT

PF00078 RVT_1 315-566 aa PF13966 zf-RVT 824-903 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808818.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	315	566	8.1e-28	98.4	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057808818.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	824	903	2.4e-16	60.9	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952835.1
ATGGTTCCTCGGCATCAAAACTCTCGGGCTACTCGCCGACCTAACATTTGGTTTTTAGCTCATTCTTCTGTGGTTACTAATATTATTCACTCTTCGGAGCAAGCTATTATTGCAGATTGCAGTTGGCAGACTTTTCATTTCCGGGTAGCAGTTGTTCATGGTGCTAATGATCAGATGATTCGCCGGAATTTGTGGGCGGAGTTGATTTCGTATTCTCATGGGAATACTGTGTTTATTGGAGACTTTAATGCCGTCAAGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023288
ATGGTTCCTCGGCATCAAAACTCTCGGGCTACTCGCCGACCTAACATTTGGTTTTTAGCTCATTCTTCTGTGGTTACTAATATTATTCACTCTTCGGAGCAAGCTATTATTGCAGATTGCAGTTGGCAGACTTTTCATTTCCGGGTAGCAGTTGTTCATGGTGCTAATGATCAGATGATTCGCCGGAATTTGTGGGCGGAGTTGATTTCGTATTCTCATGGGAATACTGTGTTTATTGGAGACTTTAATGCCGTCAAGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808818.1
MVPRHQNSRATRRPNIWFLAHSSVVTNIIHSSEQAIIADCSWQTFHFRVAVVHGANDQMIRRNLWAELISYSHGNTVFIGDFNAVKGAHERISTVRPSRSACRDFCDFIDATNFIESPTSGLQFTWSGRRLLPRHVESRLDRALFSASFADIWNDIVTHALPRLTSDHSHLIFKCNSTDNASRRPFKFLNMWVSHPSFLDMVSASWSAAVETRCPIYRGMVKLRRLRGDIRLWNRTTFGNVDRQIQEDMIQQHIIAYFST...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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