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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001936`

染色体: Chr04 坐标: 31479525-31481909 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001936`
名称	SmilChr04G001936
描述	germin-like protein subfamily 1 member 11
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	31479525 - 31481909 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019915`
GeneID	`131019915`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019915`
原始查询	`SmilChr04G001936`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	germin-like protein subfamily 1 member 11
产物	germin-like protein subfamily 1 member 11
Arabidopsis	`AT5G39110` (AT5G39110) RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833904] identity=48.9; qcov=0.957; evalue=1.45e-73; confidence=high
Rice	`Os12g0154900` (GLP12-3) - identity=47.8; qcov=0.978; evalue=8.94e-67; confidence=high
GO	GO:0005618 (cell wall); GO:0030145 (manganese ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1); PF07883 (Cupin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019915

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057804523.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057804523.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804523.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804523.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804523.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:31479709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B23,C43
`Chr4:31479872`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C72
`Chr4:31479872`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C72
`Chr4:31479914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:31479924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,C54
`Chr4:31479935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr4:31480032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:31480085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B30,C56
`Chr4:31480127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C42
`Chr4:31480211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B13,B35
`Chr4:31480238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:31481780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804523.1

231 aa

116

231

Cupin_1

Cupin_2

PF00190 Cupin_1 66-218 aa PF07883 Cupin_2 102-180 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804523.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	66	218	5.4e-44	150.1	Cupin
`XP_057804523.1`	Pfam	`PF07883`	Cupin_2	Domain	102	180	1.2e-08	35.3	Cupin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948540.1
AAAACATATAGTATCAGACATAAAGCCAAAAGAAGGTTCAGTAGTCATGAAATCATGGAGTGTAGTGCTACTACTCATCTCTACTGTCAGCCTTTTCTCGTTTCTGGCCTCCGCCGCCGATCCTGACCCGGTGCAGGATTTCTGTGTATCTGTTAACGACACAAAATTTGCCGTATTTGTGAACGGAAAGTTTTGCAAGAAGCCGGAGAGCGTGACGGCGGACGACTTCTACTACGCGGCGGGGCTGCATGAGCCCCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019915
ATGAAATCATGGAGTGTAGTGCTACTACTCATCTCTACTGTCAGCCTTTTCTCGTTTCTGGCCTCCGCCGCCGATCCTGACCCGGTGCAGGATTTCTGTGTATCTGTTAACGACACAAAATTTGCCGTATTTGTGAACGGAAAGTTTTGCAAGAAGCCGGAGAGCGTGACGGCGGACGACTTCTACTACGCGGCGGGGCTGCATGAGCCCCAACCGATAACAAGCCCTTTCGGCTCCAAAATCACGATGGCCTTCGAGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804523.1
MKSWSVVLLLISTVSLFSFLASAADPDPVQDFCVSVNDTKFAVFVNGKFCKKPESVTADDFYYAAGLHEPQPITSPFGSKITMAFERQFPALNTQGVAMSRIDFAPQGLNPPHWHPRASEMLVVLQGTLYSGFFTTNPHDPHENGTLYAKTLRPGDVFVFPRGLLHFQYNVGHDHAVAFVSFNSQNPGVVTAARLLFGAEPWVCPRMLADAFQIDVRMVAYLQSLRWEGNN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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