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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001941`

染色体: Chr04 坐标: 31527828-31531785 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001941`
名称	SmilChr04G001941
描述	uncharacterized SmilChr04G001941
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	31527828 - 31531785 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019901`
GeneID	`131019901`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019901`
原始查询	`SmilChr04G001941`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827439]; symbol=AT4G17250; hit=AT4G17250; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827439]; symbol=AT4G17250; hit=AT4G17250; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G17250` (AT4G17250) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827439] identity=38.2; qcov=0.991; evalue=3.69e-160; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019901

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057804504.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057804504.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057804504.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057804504.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804504.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:31528459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,B7
`Chr4:31528476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B23,C43,D6
`Chr4:31528590`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr4:31529260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C6,C77
`Chr4:31529394`	`C`	`CT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	36	A4,B102,B108,B119,B125,B18,B28,B36,B39,B4,B41,B44,B45,B63,B67,B69,B8,B87,B88,B9,C1,C19,C23,C26,C28,C33,C34,C38,C52,C53,C63,C64,C67,C78,C79,D3
`Chr4:31529397`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	34	B10,B102,B108,B119,B125,B18,B28,B36,B39,B4,B41,B44,B45,B63,B67,B69,B8,B87,B88,B9,C1,C19,C23,C26,C28,C33,C34,C52,C53,C63,C67,C78,C79,D3
`Chr4:31529573`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B102
`Chr4:31529573`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B102
`Chr4:31529898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C42
`Chr4:31529920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr4:31530351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B29,B82
`Chr4:31530352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B30,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948521.1
TAATTTGATTTTACTTAATGCTTTTGCGGTTCTGCCTAAGAAAAAAAATCCTCAAAATTATTTTTACGATAGAAATCACTGCATGCACGCTTTCTTGTTTCTTCGTTCATCAATCCTTCCTTCAATTTCTTCTCTGTTTATTTAGAGTTTCGTCATCGTCCTCCTCCACTGCCGCATGAGATCTGCGATATGATCCTTTTCTTATACCTCCACCCGCATTCTCCCGATCTTCACATGCTCGCAAAATTCCCCAACGCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019901
ATGGATTGCAATAGCTGCAATTATTACTGCAACAATGATTACATGGACGAAGTTCAAGACGAGCTGAACAAACCAATGCCGTGGATCGGCATGTACATTGCGGCAGCCTCTGCTGTTTGCTGTTTATCCATGGCGGCAGATCTGTGCAGTGGCTTACAAAGCAAGCGGCTCTGGTTTCCATGTAAGTACTTCTCTCTCAACGCCATCTCCTTAACAATGCTGGCTGTGACGACGAAGCTGCCGGCCGATCTCACTAGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804504.1
MDCNSCNYYCNNDYMDEVQDELNKPMPWIGMYIAAASAVCCLSMAADLCSGLQSKRLWFPCKYFSLNAISLTMLAVTTKLPADLTSDMRGVNDKLALISSIILMAVCMANFMTSLGSVDNNEMVVNLTALAILVITITANVSIHIYQMRGYSVVETIMAEEIISIFLMLFLLVALFSLALMVPSAKRYLEAEYNEMQKMVSSKPIEWGEYTIDELRIAVKRYWVMSETGSLQFVLARAAISVTASLICPLLILTLIEAHV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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