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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001966`

染色体: Chr04 坐标: 31888190-31890819 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001966`
名称	SmilChr04G001966
描述	uncharacterized SmilChr04G001966
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	31888190 - 31890819 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019939`
GeneID	`131019939`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019939`
原始查询	`SmilChr04G001966`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SIP10; symbol=SIP10; hit=Os05g0170800; species=rice; confidence=high
产物	SIP10; symbol=SIP10; hit=Os05g0170800; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G06110` (SKIP16) SKP1/ASK-interacting protein 16 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837120] identity=30.6; qcov=0.448; evalue=5.97e-07; confidence=low
Rice	`Os05g0170800` (SIP10) - identity=66.8; qcov=0.863; evalue=4.65e-96; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF02151 (UVR); PF04379 (DUF525)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019939

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057804545.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057804545.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804545.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804545.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804545.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:31888356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr4:31888468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,D11
`Chr4:31888518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B133,B94
`Chr4:31888921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr4:31889402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B138,B63,B98,C53,C80
`Chr4:31889689`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:31889752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr4:31889771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:31889829`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B29,B44
`Chr4:31889990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:31890026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:31890199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804545.1

268 aa

134

268

UVR

DUF525

PF02151 UVR 100-127 aa PF04379 DUF525 156-239 aa

XP_057804546.1

241 aa

120

241

DUF525

PF04379 DUF525 129-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804545.1`	Pfam	`PF02151`	UVR	Family	100	127	1.1e-10	41.6	UvrB/uvrC motif
`XP_057804545.1`	Pfam	`PF04379`	DUF525	Family	156	239	2.7e-33	114.8	ApaG domain
`XP_057804546.1`	Pfam	`PF04379`	DUF525	Family	129	212	2.1e-33	115.1	ApaG domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948563.1
AATTCACTATATTGCCACCAATCTCCACCCGCCTCCATGCCCATTATGGTAATTACGCGTTCCAAATTATCCTCCACTGATGAAAGTATAATCACATCAACTCCTCAACTACAGTTCGATTTTCCAAAAAAAATAAACGAGTGGTCTATACCAAAATGCATTGCTTGAATCTGAAGGTTGTGAGTGATTTCAACGCGCTGTTGTTGGCGGGTCGGCTCAGAAGCAGCGCAAAAGCCTACAATTGGCGGCTTAATCGGATA...

XM_057948562.1
CAATCTCCACCCGCCTCCATGCCCATTATGGTAATTACGCGTTCCAAATTATCCTCCACTGATGAAAGTATAATCACATCAACTCCTCAACTACAGTTCGATTTTCCAAAAAAAATAAACGAGTGGTCTATACCAAAATGCATTGCTTGAATCTGAAGGTTGTGAGTGATTTCAACGCGCTGTTGTTGGCGGGTCGGCTCAGAAGCAGCGCAAAAGCCTACAATTGGCGGCTTAATCGGATAGTCGCTTGCAGCAATCCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131019939
ATGCATTGCTTGAATCTGAAGGTTGTGAGTGATTTCAACGCGCTGTTGTTGGCGGGTCGGCTCAGAAGCAGCGCAAAAGCCTACAATTGGCGGCTTAATCGGATAGTCGCTTGCAGCAATCCGGGTTCGGGCTCGGGTCCGGTTCAAGATCCGAGCCATAGTTCGAATCTGTCGCGGACGGAGACGTATGCTCTATTGAAGCAGCAGTTGGAAGTTGCTGCAAAATCAGAGGATTACAAGGAAGCGGCTAGGCTTCGCGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804545.1
MHCLNLKVVSDFNALLLAGRLRSSAKAYNWRLNRIVACSNPGSGSGPVQDPSHSSNLSRTETYALLKQQLEVAAKSEDYKEAARLRDSLKLFEEEEPALRLQRLLKEAISQERFEDAAAYRDELKEIAPYTLLKCSSDATTLGIRVQVRSVYIAGRSQPSKGLYFYAYRIRITNLSDRPVQLLRRHWIITDANGRTETVQGTGVIGEQPVILPNTGFEYSSACPLSTSTGRMEGDYEMKHIDKVGTRTFNVAIAPFALST...

XP_057804546.1
MHCLNLKVVSDFNALLLAGRLRSSAKAYNWRLNRIVACSNPGSGSGPVQDPSHSSNLSRTETYALLKQQLEVAAKSEDYKEAARLRDSLKLFEEEEPALRLQRLLKEAISQERFEGIRVQVRSVYIAGRSQPSKGLYFYAYRIRITNLSDRPVQLLRRHWIITDANGRTETVQGTGVIGEQPVILPNTGFEYSSACPLSTSTGRMEGDYEMKHIDKVGTRTFNVAIAPFALSTFGDDISVV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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