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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001969`

染色体: Chr04 坐标: 31916403-31918646 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001969`
名称	SmilChr04G001969
描述	uncharacterized SmilChr04G001969
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	31916403 - 31918646 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023306`
GeneID	`131023306`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023306`
原始查询	`SmilChr04G001969`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827439]; symbol=AT4G17250; hit=AT4G17250; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827439]; symbol=AT4G17250; hit=AT4G17250; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G17250` (AT4G17250) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827439] identity=38.2; qcov=0.96; evalue=3.49e-151; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023306

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus membrane	核膜	0.80000	`XP_057808836.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057808836.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808836.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808836.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808836.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:31916464`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,D11
`Chr4:31916473`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	28	B102,B124,B18,B26,B34,B35,B44,B46,B50,B54,B55,B57,B64,B69,B76,B79,B88,C23,C27,C35,C38,C47,C55,C58,C7,C81,D11,D4
`Chr4:31916474`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	153	A1,A11,A14,A15,A19,A2,A20,A21,A22,A24,A3,A4,A7,A9,B1,B105,B106,B108,B109,B110,B111,B112,B114,B115,B117,B118,B12,B120,B125,B127,B129,B130,B133,B137,B138,B139,B140,B16,B19,B2,B21,B22,B23,B24,B25,B28,B3,B30,B32,B33,B36,B37,B38,B39,B4,B47,B49,B5,B51,B53,B59,B6,B60,B62,B65,B67,B70,B72,B73,B74,B77,B78,B8,B80,B82,B83,B84,B86,B87,B89,B9,B90,B92,B93,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C11,C13,C17,C18,C19,C20,C21,C22,C25,C26,C28,C29,C30,C31,C32,C33,C34,C36,C37,C39,C4,C41,C42,C44,C45,C46,C5,C50,C52,C53,C56,C57,C59,C6,C60,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C77,C78,C8,C80,C82,C83,C85,C87,D10,D3,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr4:31916541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr4:31916558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B125,B5,B59,C87
`Chr4:31916568`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B125,B5,B59,C87
`Chr4:31916585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B5,B59,C87
`Chr4:31916590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B5,B59
`Chr4:31916619`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B5,B59
`Chr4:31916619`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B5,B59
`Chr4:31916720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B5,B90,C50,C83
`Chr4:31916744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952853.1
ATGCAAGAGCGAATAACTCCTAAACTCAAACAAAGAGAAGCAGAATTAAATCGAATCGACAGAGTTAGCTTTGAGCTCATGCTTTCACGTAACTGCTCCCAATCATACGATGAATATCGGAGCATGGTGCAAGCGAAACTTGATTCAACTACGCCGTGGATAGGCGTGTATATTGCAGCAGCCTCTGCCGCCTGTACGTTTTCAATGATGGCTGATGCTATCATTGGTTTCCGAAGCAAAAAGTATTGGCTTCCATGTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023306
ATGCAAGAGCGAATAACTCCTAAACTCAAACAAAGAGAAGCAGAATTAAATCGAATCGACAGAGTTAGCTTTGAGCTCATGCTTTCACGTAACTGCTCCCAATCATACGATGAATATCGGAGCATGGTGCAAGCGAAACTTGATTCAACTACGCCGTGGATAGGCGTGTATATTGCAGCAGCCTCTGCCGCCTGTACGTTTTCAATGATGGCTGATGCTATCATTGGTTTCCGAAGCAAAAAGTATTGGCTTCCATGTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808836.1
MQERITPKLKQREAELNRIDRVSFELMLSRNCSQSYDEYRSMVQAKLDSTTPWIGVYIAAASAACTFSMMADAIIGFRSKKYWLPCKYFSLNAFSLTLLAVTMKLPVDLTSIDLNVKDKLPRISSLVLMCAGISHFMTSLGSMENNEILLNIAALGILVITIAGNVCIHTLERRSFPNVRDMLLEQVASAMIMLLVLATLCSLAVMVPGARRYMQLKYNEMHKSVSNRELEWGRTSIDEVGVLVKGYWVMAETGSPQFVV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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