Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001970`

染色体: Chr04 坐标: 31923648-31925144 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001970`
名称	SmilChr04G001970
描述	uncharacterized SmilChr04G001970
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	31923648 - 31925144 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023307`
GeneID	`131023307`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023307`
原始查询	`SmilChr04G001970`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834808]; symbol=ASG7; hit=AT5G47580; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834808]; symbol=ASG7; hit=AT5G47580; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G47580` (ASG7) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834808] identity=40.4; qcov=1.02; evalue=3.3e-115; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023307

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus membrane	核膜	0.80000	`XP_057808837.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057808837.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808837.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808837.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808837.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:31923756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	29	A16,A19,A24,A8,B1,B10,B134,B138,B139,B140,B23,B26,B38,B39,B55,B58,B63,B65,B7,B72,B79,B85,B99,C11,C15,C26,C30,C52,C59
`Chr4:31923793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C52
`Chr4:31924041`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr4:31924050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr4:31924129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B23,C43
`Chr4:31924142`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	55	A14,A18,A6,A7,B1,B10,B100,B103,B106,B107,B109,B11,B113,B115,B121,B134,B138,B19,B29,B31,B34,B40,B41,B45,B5,B61,B63,B7,B72,B73,B78,B80,B83,B94,B97,C12,C15,C20,C24,C26,C28,C3,C38,C40,C51,C53,C56,C61,C64,C66,C77,C83,D1,D2,D4
`Chr4:31924143`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	55	A14,A18,A6,A7,B1,B10,B100,B103,B106,B107,B109,B11,B113,B115,B121,B134,B138,B19,B29,B31,B34,B40,B41,B45,B5,B61,B63,B7,B72,B73,B78,B80,B83,B94,B97,C12,C15,C20,C24,C26,C28,C3,C38,C40,C51,C53,C56,C61,C64,C66,C77,C83,D1,D2,D4
`Chr4:31924166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:31924192`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C83
`Chr4:31924192`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C83
`Chr4:31924228`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr4:31924350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	B102,B124,B18,B31,B44,B46,B55,B64,B69,B79,C23,C38,C47,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952854.1
ATGGCAGAAACTGGTAGCCCTCAGTTTGTGGTGGCAAGGTCTGCCATCTCTGGCACCTCAGGTCTCTTGTGTCTATTGGCAGCTCTAACTTTGGCATTGGCTCGTGCTCGATCTTTGGTGGTGGCTCCAAGCTCGGGTTTTAGACGAGAAATCTCTAACTATAGGTGGTCCATCAAATGGATTTTGTGCATTCAGTTTGTTGGAGTGGTGATTGGAACCATTGCTCCTCTATTCAGATGGTTTGTTGCTTCGTGGTTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023307
ATGGCAGAAACTGGTAGCCCTCAGTTTGTGGTGGCAAGGTCTGCCATCTCTGGCACCTCAGGTCTCTTGTGTCTATTGGCAGCTCTAACTTTGGCATTGGCTCGTGCTCGATCTTTGGTGGTGGCTCCAAGCTCGGGTTTTAGACGAGAAATCTCTAACTATAGGTGGTCCATCAAATGGATTTTGTGCATTCAGTTTGTTGGAGTGGTGATTGGAACCATTGCTCCTCTATTCAGATGGTTTGTTGCTTCGTGGTTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808837.1
MAETGSPQFVVARSAISGTSGLLCLLAALTLALARARSLVVAPSSGFRREISNYRWSIKWILCIQFVGVVIGTIAPLFRWFVASWFKISEMERKSFGDEIKIEEYWTSRLVEWRGRSLPFQVQNRVWKKLLRDAVRLLVNFCIGVQIIFVSAGKIVLFLSARFGKAIFLCFCKNLRPHSMRESESRDGAEVDFSNYVLLLEGERQLPDQILKNICNEVDRLMQIGENKQPKNLIRLLKKSANFNGVGQFDSSQVPSLHSQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器