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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001981`

染色体: Chr04 坐标: 32089024-32090649 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001981`
名称	SmilChr04G001981
描述	iron-sulfur cluster assembly protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	32089024 - 32090649 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019950`
GeneID	`131019950`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019950`
原始查询	`SmilChr04G001981`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	iron-sulfur cluster assembly protein 1-like
产物	iron-sulfur cluster assembly protein 1-like
Arabidopsis	`AT4G22220` (ISU1) SufE/NifU family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828316] identity=74.5; qcov=0.969; evalue=2.85e-83; confidence=high
Rice	`Os01g0662600` (OsISC6) - identity=85.9; qcov=0.79; evalue=4.87e-80; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005759 (mitochondrial matrix); GO:0006879 (intracellular iron ion homeostasis); GO:0008198 (ferrous iron binding); GO:0016226 (iron-sulfur cluster assembly); GO:0051537 (2 iron, 2 sulfur cluster binding)
KEGG	-
Pfam	PF01592 (NifU_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019950

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057804555.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057804555.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804555.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804555.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804555.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:32089236`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B1,B36
`Chr4:32089236`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B1,B36
`Chr4:32089301`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B133,B94,C17
`Chr4:32089305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr4:32089323`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A15
`Chr4:32089323`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A15
`Chr4:32089326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B95

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804555.1

162 aa

162

NifU_N

PF01592 NifU_N 24-148 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804555.1`	Pfam	`PF01592`	NifU_N	Family	24	148	1.1e-54	184.7	NifU-like N terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948572.1
TGGCGCCAACCATTCACAAAGTTCCACCACAAGCGCGTAACTCCACCGCCGCCTCAGATAACTATAAAAACGAATCCGATTCCCTCAAAATGGAAAAAGGAAGCTCCAAAGTTCCCAATTTTCGATAAGTCCAACTTCGCTTCCATTTCTCGATCAATCGCAAAATGTTGAGGCAAGCAACGAGCAGGGTTATCGGCTGGCGGCTGTCGCCGGCGGGACCGCCGCTGAGGTTGTACCACGAGAGGGTGGTGGACCACTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019950
ATGTTGAGGCAAGCAACGAGCAGGGTTATCGGCTGGCGGCTGTCGCCGGCGGGACCGCCGCTGAGGTTGTACCACGAGAGGGTGGTGGACCACTACAACAACCCGCGGAACGTCGGAGCGTTCGATAAAAACGATTCCGGCGTCGGAACAGGACTAGTCGGAGCGCCGGCGTGCGGCGACGTGATGAAATTGCAGATTAAGGTCGATGAGGAGAGCGGGAAAATCGTCGATGCTTGTTTTAAGACCTTCGGCTGCGGCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804555.1
MLRQATSRVIGWRLSPAGPPLRLYHERVVDHYNNPRNVGAFDKNDSGVGTGLVGAPACGDVMKLQIKVDEESGKIVDACFKTFGCGSAIASSSVATEWVKGRPVEEVLSIKNTEIAKHLSLPPVKLHCSMLAEDAIKAAVKDYEAKHSKSSGATPLEMPLSG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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