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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001984`

染色体: Chr04 坐标: 32137963-32142732 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001984`
名称	SmilChr04G001984
描述	uncharacterized SmilChr04G001984
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	32137963 - 32142732 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019952`
GeneID	`131019952`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019952`
原始查询	`SmilChr04G001984`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Tudor/PWWP/MBT superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834032]; symbol=AT5G40340; hit=AT5G40340; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Tudor/PWWP/MBT superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834032]; symbol=AT5G40340; hit=AT5G40340; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT5G40340` (AT5G40340) Tudor/PWWP/MBT superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834032] identity=31.5; qcov=0.156; evalue=2.85e-24; confidence=weak
Rice	`Os05g0463500` - identity=32.3; qcov=0.165; evalue=1.57e-22; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00855 (PWWP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019952

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804560.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804560.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804560.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804560.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057804560.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:32138588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr4:32138630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr4:32138707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C23
`Chr4:32138807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr4:32138820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr4:32139129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,C85,D6
`Chr4:32139279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr4:32139415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr4:32139419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B38,B39,C13,C41
`Chr4:32139806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:32139973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B121,B60,B81
`Chr4:32139978`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804560.1

1142 aa

571

1142

PWWP

PF00855 PWWP 254-334 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804560.1`	Pfam	`PF00855`	PWWP	Domain	254	334	3.4e-15	57.0	PWWP domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948577.1
GCACACTTTTTTGAATGCCTCTTTTTCCAAATATTTTGCCGTCGTCTTCAATGTTTCCAGTTACTCCCACAAACAGTCACTAATCACTCTTCTCTCTCTCTCCTAAACCTCCTTCTCTCTCAACCCATTACCTATTTCGGCAAAATATAGATTCTCCACATTTTGCTGCAGCTTTGAATTTGATGGGTGTTTGATTATATGGAAAAAAGGTGTAATCTTTGTGGCACATTCTTGAAATGGAAAGTAGGAAGAACGCAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019952
ATGGAAAGTAGGAAGAACGCAGAAACCCTAAAAGATGGTTTCTTGGAGTCGAAATTGAGTCAGAATGAAATCTTTTCTAATGAAGTCCGTGAAGATGGGAGCCTTGTTGGTTGCTTAAGTGATTTAAATGAGAAGTGTGTGCCTGATGCTTGTAGTAGTAGAAATGAATTAAGCAATGTTGAGTTAGCAAGACTATTTGGTGATGGGAGTGTTGATGTATCTATGGTTGATGGTGTTGCTGGATACGATAGGATGAAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804560.1
MESRKNAETLKDGFLESKLSQNEIFSNEVREDGSLVGCLSDLNEKCVPDACSSRNELSNVELARLFGDGSVDVSMVDGVAGYDRMKEGSVYGYPDEKLMASLQANDVYDNDFPVFKEELSFNGNGGDQSAKVKESVGKFGDTLLCDEPFHDGEIEAPMEKCDDVLHPHEPGSPTKIEVSGNSINLFVEVFGPLDGISDDDWDDPVECKSGESDIKQDFSPEENCTLSTGDTDLSSKYEGEEDIIGEQEHTFDNGDLVWLK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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