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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001985`

染色体: Chr04 坐标: 32143712-32145383 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001985`
名称	SmilChr04G001985
描述	dof zinc finger protein DOF5.6
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	32143712 - 32145383 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019954`
GeneID	`131019954`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019954`
原始查询	`SmilChr04G001985`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dof zinc finger protein DOF5.6
产物	dof zinc finger protein DOF5.6
Arabidopsis	`AT5G62940` (HCA2) Dof-type zinc finger DNA-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836414] identity=38.5; qcov=1.26; evalue=1.78e-51; confidence=medium
Rice	`Os02g0707200` (OsDof7) - identity=38; qcov=1.07; evalue=4.18e-51; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02701 (Zn_ribbon_Dof)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019954

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804561.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804561.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804561.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804561.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057804561.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:32144145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B87,C78,D9
`Chr4:32144396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B35
`Chr4:32144558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C57
`Chr4:32144575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr4:32144633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,C59,C84
`Chr4:32144831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804561.1

302 aa

151

302

Zn_ribbon_Dof

PF02701 Zn_ribbon_Dof 61-117 aa

XP_057804562.1

301 aa

150

301

Zn_ribbon_Dof

PF02701 Zn_ribbon_Dof 60-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804561.1`	Pfam	`PF02701`	Zn_ribbon_Dof	Family	61	117	1.8e-33	115.1	Dof domain, zinc finger
`XP_057804562.1`	Pfam	`PF02701`	Zn_ribbon_Dof	Family	60	116	1.9e-33	115.1	Dof domain, zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948579.1
TTCCAGATTTATGAGCATCGCAGCCGTTGATTGTTTCTGGCGTGGGGCCCGCCCCTTACCGACGAGTGAGAGCAGCAGCAGCAGTCAGTGTTGCCACCCCCACCCCCGCCCCCTCGCTCGCTTTTTCTTCCTTCTTATTCACAATCAACCCCCACTCCTCCATTCGCTATTCTCTCTCTCTCTCCTACAACTCCAACTGCTGGAACGTTTCTTCATAGTATATGGGCATTACCTCTCTGCAAGTCTGCATGGATTCATCT...

XM_057948578.1
CCCTCGCTCGCTTTTTCTTCCTTCTTATTCACAATCAACCCCCACTCCTCCATTCGCTATTCTCTCTCTCTCTCCTACAACTCCAACTGCTGGAACGTTTCTTCATAGTATATGGGCATTACCTCTCTGCAAGTCTGCATGGATTCATCTGACTGGTTGCAGCAGGGCACAATTTCCGAGGAGGGCGGCACAGGCATGGAGTCGTCGTCCCCAATGACGACCCCGACCGGCGACGACATGCTGGCATGCAGCCGCCCCCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131019954
ATGGGCATTACCTCTCTGCAAGTCTGCATGGATTCATCTGACTGGTTGCAGGGCACAATTTCCGAGGAGGGCGGCACAGGCATGGAGTCGTCGTCCCCAATGACGACCCCGACCGGCGACGACATGCTGGCATGCAGCCGCCCCCTGATGGAGCGGCGCCTCCGCCCCCAGCACGAGCAGTCCCTCAAGTGCCCCCGCTGCGACTCCACCCACACCAAATTCTGCTACTACAACAACTACAGCCTTTCCCAGCCCCGCTA...

LOC131019954
ATGGGCATTACCTCTCTGCAAGTCTGCATGGATTCATCTGACTGGTTGCAGCAGGGCACAATTTCCGAGGAGGGCGGCACAGGCATGGAGTCGTCGTCCCCAATGACGACCCCGACCGGCGACGACATGCTGGCATGCAGCCGCCCCCTGATGGAGCGGCGCCTCCGCCCCCAGCACGAGCAGTCCCTCAAGTGCCCCCGCTGCGACTCCACCCACACCAAATTCTGCTACTACAACAACTACAGCCTTTCCCAGCCCCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804561.1
MGITSLQVCMDSSDWLQQGTISEEGGTGMESSSPMTTPTGDDMLACSRPLMERRLRPQHEQSLKCPRCDSTHTKFCYYNNYSLSQPRYFCKTCRRYWTKGGTLRNIPVGGGCRKNNKKSSSSSSKKADNNSPAQPSVGMSMSPQMSYAPTDLHLAFPDQLHFHASAGLYGTTPTYMLDNNPTPIDFMDNKYEALLGGHDSYINGGGMAAPPLNAALFSPFGFDQNQTVLERLMLPYDNNTQNDVVETKPNAKILSLEWHD...

XP_057804562.1
MGITSLQVCMDSSDWLQGTISEEGGTGMESSSPMTTPTGDDMLACSRPLMERRLRPQHEQSLKCPRCDSTHTKFCYYNNYSLSQPRYFCKTCRRYWTKGGTLRNIPVGGGCRKNNKKSSSSSSKKADNNSPAQPSVGMSMSPQMSYAPTDLHLAFPDQLHFHASAGLYGTTPTYMLDNNPTPIDFMDNKYEALLGGHDSYINGGGMAAPPLNAALFSPFGFDQNQTVLERLMLPYDNNTQNDVVETKPNAKILSLEWHDH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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