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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001993`

染色体: Chr04 坐标: 32234830-32236495 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001993`
名称	SmilChr04G001993
描述	uncharacterized SmilChr04G001993
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	32234830 - 32236495 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019958`
GeneID	`131019958`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019958`
原始查询	`SmilChr04G001993`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837107]; symbol=AT1G05970; hit=AT1G05970; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837107]; symbol=AT1G05970; hit=AT1G05970; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G05970` (AT1G05970) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837107] identity=37.8; qcov=1; evalue=4.03e-33; confidence=medium
Rice	`Os04g0689700` - identity=37; qcov=1.04; evalue=9e-27; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019958

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804570.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057804579.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057804578.1`
4	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057804576.1`
5	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.20000	`XP_057804579.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:32235467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,C83
`Chr4:32235565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B34,C50,C7,C85
`Chr4:32235738`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804570.1

202 aa

101

202

RRM_1

PF00076 RRM_1 20-83 aa

XP_057804571.1

202 aa

101

202

RRM_1

PF00076 RRM_1 20-83 aa

XP_057804572.1

199 aa

100

199

RRM_1

PF00076 RRM_1 20-83 aa

XP_057804573.1

199 aa

100

199

RRM_1

PF00076 RRM_1 20-83 aa

XP_057804574.1

178 aa

178

RRM_1

PF00076 RRM_1 20-83 aa

XP_057804575.1

178 aa

178

RRM_1

PF00076 RRM_1 20-83 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804570.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	20	83	3.4e-08	34.0	RNA recognition motif
`XP_057804571.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	20	83	3.4e-08	34.0	RNA recognition motif
`XP_057804572.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	20	83	3.5e-08	33.9	RNA recognition motif
`XP_057804573.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	20	83	3.5e-08	33.9	RNA recognition motif
`XP_057804574.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	20	83	2.8e-08	34.2	RNA recognition motif
`XP_057804575.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	20	83	2.8e-08	34.2	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

12 records

下载 cDNA FASTA

XR_009100560.1
CACTAACTCATGAAAATAACTAAACTTCCAAAAATTGATTTCAAACCCTAAAATCCGATCCACCGCTGTCAGCAGCTCAATTGGTTGATCAAAGCAGGTACCTCTCTCCCATCTTCAATTCCAGAGTTTGGGGACACAGCAGCAGATTCAAGAAAAGGCAAAAAAAGAAATCTTGGATTGATGGGCACATCTGCAGAAGAAGTGTATGCAGCATTCTTGGAAAAGGTTAAAAGGACAATTTATGTGGATAACTTGTCACC...

XR_009100559.1
CATGAAAATAACTAAACTTCCAAAAATTGATTTCAAACCCTAAAATCCGATCCACCGCTGTCAGCAGCTCAATTGGTTGATCAAAGCAGGTACCTCTCTCCCATCTTCAATTCCAGAGTTTGGGGACACAGCAGCAGATTCAAGAAAAGGTATTTTATGGAAGATGATTTCACCTTATATTTGTTTTTTATAGTGAAGATATTGATTGAATTTTGTTGGTGTGATTACTGAAATCCATGTTTATGCTTAAAATTGCTTAA...

CDS

10 records

下载 CDS FASTA

LOC131019958
ATGGGCACATCTGCAGAAGAAGTGTATGCAGCATTCTTGGAAAAGGTTAAAAGGACAATTTATGTGGATAACTTGTCACCCCAAGTTACTGAACCTGTGGTGAGAACTGCTTTTAATCAGTTTGGGTATGTGAAGAGTGTTCAGTTCATCTCCATCTATCTGGAATCGAAGAATGCGCCACAAGCTGCTCTCGTGGAGATGGAAAACCCGAAACAGGCGAGCTCAATCATAACTGAGATGGGGAGTTACCCTTTCATGAT...

Protein

10 records

下载 Protein FASTA

XP_057804570.1
MGTSAEEVYAAFLEKVKRTIYVDNLSPQVTEPVVRTAFNQFGYVKSVQFISIYLESKNAPQAALVEMENPKQASSIITEMGSYPFMILGMPRPIRASAARLEMFDDRPRKPGRKILCRWLDPKEPEFQVAKKLKCAVRKHAAETLAMLEVNLEQRAEEEKLASQQSETLLAQYKKYDLLQAVFEDGSAKRLGRHYEMPVADA

XP_057804571.1
MGTSAEEVYAAFLEKVKRTIYVDNLSPQVTEPVVRTAFNQFGYVKSVQFISIYLESKNAPQAALVEMENPKQASSIITEMGSYPFMILGMPRPIRASAARLEMFDDRPRKPGRKILCRWLDPKEPEFQVAKKLKCAVRKHAAETLAMLEVNLEQRAEEEKLASQQSETLLAQYKKYDLLQAVFEDGSAKRLGRHYEMPVADA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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