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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001999`

染色体: Chr04 坐标: 32335424-32338453 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001999`
名称	SmilChr04G001999
描述	serine/threonine/tyrosine-protein kinase HT1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	32335424 - 32338453 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019964`
GeneID	`131019964`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019964`
原始查询	`SmilChr04G001999`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine/tyrosine-protein kinase HT1-like
产物	serine/threonine/tyrosine-protein kinase HT1-like
Arabidopsis	`AT1G62400` (HT1) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842538] identity=65.5; qcov=0.817; evalue=1.87e-140; confidence=high
Rice	`Os06g0636600` (HT1) - identity=64.1; qcov=0.761; evalue=1.32e-129; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF17667 (Pkinase_fungal)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019964

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057804585.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057804585.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057804585.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804585.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804585.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:32335794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr4:32335795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr4:32335807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C85
`Chr4:32335933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C7
`Chr4:32336596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:32336641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:32336944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr4:32337776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B100,C54,C86,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804585.1

355 aa

178

355

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

Pkinase_fungal

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 60-312 aa PF00069 Pkinase 65-309 aa PF17667 Pkinase_fungal 167-244 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804585.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	60	312	2.5e-63	214.5	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057804585.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	65	309	5e-54	184.2	Protein kinase domain
`XP_057804585.1`	Pfam	`PF17667`	Pkinase_fungal	Domain	167	244	1.5e-06	27.9	Fungal protein kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948602.1
GATCTTCGCACGTTATGAATGTTTACTCACTTTGTACTACTTGGAATTTACTCTCTCTCTCTCTCTTCATAACTCTTATGCTAATCAGTCATCACACTTCTTCTACAGAAGACACAGAGAGACAACCGCCATCCCCCCCCCCCCCCCTCTCTCGCTCAGCTTCAACACCTTCTCTGTCTGTCTTTCTCACTAGAACCTCTTGTTTTTGGGTGAAATCTCGCAATTCTTTCTTCTTACCATATTTCGGCTCTTATTTGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019964
ATGAAGAATTTCCAGTGGCTGAAGCAAATAGCAAACACGCACAGCAAGCTGGAGAGGAGGCTTTCGTTGGGAGAGTACAAGAGAGCGATTTCATGGTCGAAATACTTGGTTTCTTCGGGAGCGGAGATCAAAGGCGGAGGAGAGGATGAATGGAGCGCTGACATGTCGCAGCTTTACATAGGCAACAAATTCGCCTCTGGGAGGCACAGCAGAATTTACAGAGGCGTTTATAAGCAGAGAGATGTGGCGATTAAGCTGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804585.1
MKNFQWLKQIANTHSKLERRLSLGEYKRAISWSKYLVSSGAEIKGGGEDEWSADMSQLYIGNKFASGRHSRIYRGVYKQRDVAIKLISQPEEDGDLAAFLEKQFTSEVALLFRLRHPNIISFIAACKKPPVFCIITEYYPGGSLRKYLHQQGPYSLPLDLVLRLALDIAHGMQYLHARGILHRDLKSENLLLDEDMCVKVADFGISCLETQCGSAKGFTGTYRWMAPEMIKEKHHTKKVDVYSFGIVMWELLTALIPFDD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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