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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002001`

染色体: Chr04 坐标: 32409244-32413321 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002001`
名称	SmilChr04G002001
描述	protein EXECUTER 2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	32409244 - 32413321 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019966`
GeneID	`131019966`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019966`
原始查询	`SmilChr04G002001`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein EXECUTER 2, chloroplastic
产物	protein EXECUTER 2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G27510` (EX2) UvrB/UvrC domain protein (DUF3506) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839642] identity=58; qcov=0.855; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0107900` (EX2) - identity=53.3; qcov=0.882; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000304 (response to singlet oxygen); GO:0010343 (singlet oxygen-mediated programmed cell death); GO:0042651 (thylakoid membrane)
KEGG	-
Pfam	PF12014 (Cyclin_D1_bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019966

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057804587.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057804587.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804587.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804587.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804587.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:32409550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:32409889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr4:32409899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B12,B35,B53,D7
`Chr4:32410329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr4:32410330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C18
`Chr4:32410502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr4:32410545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C43
`Chr4:32410552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr4:32410922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr4:32410961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr4:32410991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:32411337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804587.1

665 aa

332

665

Cyclin_D1_bind

PF12014 Cyclin_D1_bind 504-630 aa

XP_057804588.1

663 aa

332

663

Cyclin_D1_bind

PF12014 Cyclin_D1_bind 504-661 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804587.1`	Pfam	`PF12014`	Cyclin_D1_bind	Domain	504	630	4.4e-29	102.6	Cyclin D1 binding domain
`XP_057804588.1`	Pfam	`PF12014`	Cyclin_D1_bind	Domain	504	661	2e-33	116.7	Cyclin D1 binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948605.1
TCGTAGTAGTCGTAGAAACAAAAAGAAGCACAAGAATTATCTTGTCTCCGATTCCATCATTCTATCCATAACCAATCTCTGTTACTCCCACACATACCCACCGCCGACGCTACACATGGCGGTTGCCAACGCTTGGGCTACGACGGGACACTCTGCCGTGCCTCCGCCGCAGCTCCGCCCCTCCTCCTCCGCCGCTTCCACCGAAAACCTCACCCCTCTTTTGAAGAAGAAGTTCTCACCCAATTTACCCAATAAGTCTA...

XM_057948604.1
GTAGTAGTCGTAGAAACAAAAAGAAGCACAAGAATTATCTTGTCTCCGATTCCATCATTCTATCCATAACCAATCTCTGTTACTCCCACACATACCCACCGCCGACGCTACACATGGCGGTTGCCAACGCTTGGGCTACGACGGGACACTCTGCCGTGCCTCCGCCGCAGCTCCGCCCCTCCTCCTCCGCCGCTTCCACCGAAAACCTCACCCCTCTTTTGAAGAAGAAGTTCTCACCCAATTTACCCAATAAGTCTATC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131019966
ATGGCGGTTGCCAACGCTTGGGCTACGACGGGACACTCTGCCGTGCCTCCGCCGCAGCTCCGCCCCTCCTCCTCCGCCGCTTCCACCGAAAACCTCACCCCTCTTTTGAAGAAGAAGTTCTCACCCAATTTACCCAATAAGTCTATCATCAGAAGAAGCAGGAAATCTAAGCTATTCTGCCACTGCAGCAGCGATTTTCAAAACAATAAGAATCACAGTGAGAGTGGCAGCAGCGATTTGAGTTCTTCTTCGAGTTGCTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804587.1
MAVANAWATTGHSAVPPPQLRPSSSAASTENLTPLLKKKFSPNLPNKSIIRRSRKSKLFCHCSSDFQNNKNHSESGSSDLSSSSSCSSSLWAPSSVDWDWNRWTRHFSEIEQAENYASVLKFQLEEAIEKEDFQEAAKLKIAIAEATSKDSIAEIMSQLKSAIDEERYHDASRLCRNTGSGLVGWWVGYSKDLDDPFGRIIRITPGTGRFIGKTYSPRQLVTSSPGTPLFEIFVVKNDDGRYSMQVAFLKQTKGISANST...

XP_057804588.1
MAVANAWATTGHSAVPPPQLRPSSSAASTENLTPLLKKKFSPNLPNKSIIRRSRKSKLFCHCSSDFQNNKNHSESGSSDLSSSSSCSSSLWAPSSVDWDWNRWTRHFSEIEQAENYASVLKFQLEEAIEKEDFQEAAKLKIAIAEATSKDSIAEIMSQLKSAIDEERYHDASRLCRNTGSGLVGWWVGYSKDLDDPFGRIIRITPGTGRFIGKTYSPRQLVTSSPGTPLFEIFVVKNDDGRYSMQVAFLKQTKGISANST...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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