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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002014`

染色体: Chr04 坐标: 32672832-32673872 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002014`
名称	SmilChr04G002014
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	32672832 - 32673872 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023319`
GeneID	`131023319`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023319`
原始查询	`SmilChr04G002014`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
产物	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
Arabidopsis	`AT3G42170` (DAYSLEEPER) BED zinc finger and hAT dimerization domain-containing protein DAYSLEEPER [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3769417] identity=32.5; qcov=1.03; evalue=1.14e-51; confidence=low
Rice	`Os03g0822100` - identity=36.1; qcov=0.986; evalue=2.62e-72; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF27039 (ZBED1_RNase-like_helical); PF27041 (ZBED1_RNase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023319

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808847.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808847.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808847.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808847.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808847.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:32672852`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,C19,C84
`Chr4:32673185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B92
`Chr4:32673224`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C30,C85
`Chr4:32673224`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C30,C85
`Chr4:32673275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B92,C36,C49,C81,C85
`Chr4:32673370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B16,B70,C3
`Chr4:32673397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B59,C24,C29,C81
`Chr4:32673407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,A21,B110,D4
`Chr4:32673429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B129,B31,C29
`Chr4:32673454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A22,B115,B124,B134,B16,B3,B30,B59,B60,B69,B70,B82,B83,C23,C24,C29,C3,C30,C36,C39,C49,C56,C81,C84,C85
`Chr4:32673462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B132,B47,B55
`Chr4:32673493`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A22,B83,C36,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808847.1

346 aa

173

346

ZBED1_RNase-like

ZBED1_RNase-like_helical

PF27041 ZBED1_RNase-like 163-258 aa PF27039 ZBED1_RNase-like_helical 262-344 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808847.1`	Pfam	`PF27041`	ZBED1_RNase-like	Domain	163	258	9.3e-33	113.0	ZBED1 RNase-like domain
`XP_057808847.1`	Pfam	`PF27039`	ZBED1_RNase-like_helical	Domain	262	344	1.2e-29	103.3	ZBED1 RNase-like helical domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952864.1
ATGACAAAGAAAAGAAAACGCACGTCCAAAGTGTGGGATGACTTCAAAGAGATCATTGATGTAAAAGGAAATGTGAAAGCCGAATGCATTCATTGCAAGACACGGCTATCAGTCAACAAGACTGGTTGTACAACTCACTTGGCTAGACATAGTGCCAAATGCACTGCTAAACAAATTCACAGCACGAAAGGCCAACAAAATATCAGCATCACAATGTCTATGGCTCAGAAGGAAGCGGTGAGCTCTGTCACTAATTTTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023319
ATGACAAAGAAAAGAAAACGCACGTCCAAAGTGTGGGATGACTTCAAAGAGATCATTGATGTAAAAGGAAATGTGAAAGCCGAATGCATTCATTGCAAGACACGGCTATCAGTCAACAAGACTGGTTGTACAACTCACTTGGCTAGACATAGTGCCAAATGCACTGCTAAACAAATTCACAGCACGAAAGGCCAACAAAATATCAGCATCACAATGTCTATGGCTCAGAAGGAAGCGGTGAGCTCTGTCACTAATTTTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808847.1
MTKKRKRTSKVWDDFKEIIDVKGNVKAECIHCKTRLSVNKTGCTTHLARHSAKCTAKQIHSTKGQQNISITMSMAQKEAVSSVTNFKYDHSKIREVLSHMIIVHELPFRFPEYELFNLLMKSATPLYNKISRATAKKDCWASYELEKKRLMNELKGVSRVSVTTDLWTSDQNISYMVVTGHYVDSNWNLQKRTLNFCDIPPPHTGVVISDVLQRCFREWGIEEKVWTITVDNASNNDVAVRILKENLLFRHTLPLGGQIF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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