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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002015`

染色体: Chr04 坐标: 32676374-32677365 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002015`
名称	SmilChr04G002015
描述	protein DELETION OF SUV3 SUPPRESSOR 1(I)-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	32676374 - 32677365 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021186`
GeneID	`131021186`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021186`
原始查询	`SmilChr04G002015`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DELETION OF SUV3 SUPPRESSOR 1(I)-like
产物	protein DELETION OF SUV3 SUPPRESSOR 1(I)-like
Arabidopsis	`AT1G64750` (DSS1(I)) deletion of SUV3 suppressor 1(I) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842783] identity=73.5; qcov=0.907; evalue=5.46e-08; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0000502 (proteasome complex); GO:0000724 (double-strand break repair via homologous recombination); GO:0006406 (mRNA export from nucleus); GO:0008541 (proteasome regulatory particle, lid subcomplex); GO:0043248 (proteasome assembly)
KEGG	smil03050 (Proteasome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03440 (Homologous recombination - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05160 (DSS1_SEM1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021186

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057806262.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057806262.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057806262.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806262.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806262.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:32676547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,A8,B107,C63,C87
`Chr4:32676567`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	29	A15,A3,A9,B105,B111,B12,B133,B137,B16,B18,B24,B28,B32,B50,B55,B60,B77,B98,C2,C20,C25,C34,C5,C64,C66,C73,C83,D2,D8
`Chr4:32676572`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A16,A3,B118,B137,B80,C41,C58,C59,C78,C84
`Chr4:32677114`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B76
`Chr4:32677114`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B76
`Chr4:32677150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr4:32677161`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C1
`Chr4:32677161`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C1
`Chr4:32677178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806262.1

75 aa

DSS1_SEM1

PF05160 DSS1_SEM1 11-69 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806262.1`	Pfam	`PF05160`	DSS1_SEM1	Family	11	69	2.9e-18	66.4	DSS1/SEM1 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950279.1
CGATATCATTTAATCGAAAAATAGCGTCAATAATTGGAAATCTTCTTAGATCACTCACTCTGAGATTTTATCAATGGCGACGGAAAGGCAGAAACCAGCATCTGAGGAAGTAAAGACCGATCTATTTGAAGATGATGACGAGTTTGAGGAGTTTGAAATTGATCGAGATTGGGACGAGCAAGATGAAGGCGAAGAAATGAGTCAGCAGTGGGAAGATGACTGGGATGATGATGATGTGAACGATGATTTCTCGGTGCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021186
ATGGCGACGGAAAGGCAGAAACCAGCATCTGAGGAAGTAAAGACCGATCTATTTGAAGATGATGACGAGTTTGAGGAGTTTGAAATTGATCGAGATTGGGACGAGCAAGATGAAGGCGAAGAAATGAGTCAGCAGTGGGAAGATGACTGGGATGATGATGATGTGAACGATGATTTCTCGGTGCAGCTGAGGAAGGAATTGGAGAGGAATGAGGCTAAGTCCACATGA

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806262.1
MATERQKPASEEVKTDLFEDDDEFEEFEIDRDWDEQDEGEEMSQQWEDDWDDDDVNDDFSVQLRKELERNEAKST

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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