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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002020`

染色体: Chr04 坐标: 32772040-32773361 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002020`
名称	SmilChr04G002020
描述	protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 2
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	32772040 - 32773361 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021190`
GeneID	`131021190`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021190`
原始查询	`SmilChr04G002020`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 2
产物	protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 2
Arabidopsis	`AT1G24450` (NFD2) Ribonuclease III family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839061] identity=49.4; qcov=0.952; evalue=7.87e-55; confidence=high
Rice	`Os03g0854400` - identity=50.7; qcov=0.738; evalue=6.07e-31; confidence=medium
GO	GO:0003725 (double-stranded RNA binding); GO:0004525 (ribonuclease III activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006364 (rRNA processing); GO:0010468 (regulation of gene expression)
KEGG	-
Pfam	PF14622 (Ribonucleas_3_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021190

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057806271.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057806271.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806271.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806271.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806271.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:32773006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B65,B77,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806271.1

187 aa

187

Ribonucleas_3_3

PF14622 Ribonucleas_3_3 62-167 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806271.1`	Pfam	`PF14622`	Ribonucleas_3_3	Family	62	167	3e-11	44.3	Ribonuclease-III-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950288.1
GAAGCCCAACAATCACTAGTACTCCATCAGTTAGCACTGCCAACAGTGAAAAGGAAAAGTAGAATCTTCTAAACAAATTAAGAAGTTGAATTTGCAGAAGAGGTAAAGGTAAAGGTAAACATCGTCACTCCCACTATTACAGTTCACCTCTCAAAATCACTGAATTTCCCATCGTCGTAGCAACGACTACGGAGCCCGAACATGGGTTTTAGGGTTTCTATTGTGCTCCTCTCTCTCTTGGTTGCCCTCCTTTCCCCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021190
ATGGGTTTTAGGGTTTCTATTGTGCTCCTCTCTCTCTTGGTTGCCCTCCTTTCCCCCTCTGCGCAGGCATTTTCAGATGAAGAATCATCTTTGCCGGAGCTCTCGTTAAGAGTTTCAACGCCTTTCTCGAACGCACTCGCCAATCTGCAAAATCAGATCAACTATACGTTTAAGCGAGTTGGATTGCTGCGGCGTGCAATGACACACTCCTCCTACTCAGAGGAGAATAACAAGGCTCTGAGTGTTTTGGGCGAAAGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806271.1
MGFRVSIVLLSLLVALLSPSAQAFSDEESSLPELSLRVSTPFSNALANLQNQINYTFKRVGLLRRAMTHSSYSEENNKALSVLGESVIETSVALQSLRKDVDISAKDLNLAITEASKVEGSCNADGIRLGLQNVVRVASKTNATAPAVVCGAFRALFGAIAIDAGSSDEAGDVYGKTRSGVRSAVTM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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