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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002027`

染色体: Chr04 坐标: 32959603-32963568 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002027`
名称	SmilChr04G002027
描述	nucleobase-ascorbate transporter 6-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	32959603 - 32963568 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021198`
GeneID	`131021198`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021198`
原始查询	`SmilChr04G002027`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nucleobase-ascorbate transporter 6-like
产物	nucleobase-ascorbate transporter 6-like
Arabidopsis	`AT5G62890` (AT5G62890) Xanthine/uracil permease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836409] identity=79.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0741800` - identity=74.8; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009506 (plasmodesma); GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00860 (Xan_ur_permease)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021198

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057806280.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806280.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806280.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806280.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806280.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:32960930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B18,B77,C48
`Chr4:32961895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr4:32961914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr4:32962117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr4:32962602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr4:32962941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr4:32963017`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B103,C76,C9
`Chr4:32963168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B109,C28,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806280.1

525 aa

262

525

Xan_ur_permease

PF00860 Xan_ur_permease 33-435 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806280.1`	Pfam	`PF00860`	Xan_ur_permease	Family	33	435	9.6e-65	219.5	Permease family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950297.1
TCTCATCAGTTTATGTTCCCAGTCCTTTTTCTTGCACTTGCAGAGAGAGGGTGGTGATTGCAGTATAAAATTTGGGACCAGTTTTTCATCTTTTTATCTTGACATTTTGCTCACTCTTTTTCTAGACTTCTTTTCTCCCCTCACCTTTGTGCAAGAAAATGTTCTCTTAGCATTGCCACCTCTCTACAAATACAAAGTTCTCTCCTTTTTTTTTTGTTGTGCCTGATTTCGAATTTATGTTTATGTGGGGTCTCTAGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021198
ATGGCAGCAAAGCTAGATGAACCAGCGCCACACCCTCCTAAAGATCAACTTCCAAATGTTGCATACTGCATCACCAGCCCTCCTCCATGGCCTGAGGCTATCCTTCTTGGTTTTCAACATTATTTGGTGGTTCTGGGCACGACTGTCCTCATACCGACTGCATTGGTTCCTCAAATGGGAGGAGGAAACGAGGAGAAAGCAAAAGTTATTCAGACTCTGCTGTTTGTTGCTGGGCTCAACACCCTCCTGCAAACATGGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806280.1
MAAKLDEPAPHPPKDQLPNVAYCITSPPPWPEAILLGFQHYLVVLGTTVLIPTALVPQMGGGNEEKAKVIQTLLFVAGLNTLLQTWFGTRLPAVIGGSYTFVAPTISIILSGRWDDPDPIMRFKKIMRATQGALIVASTIQIVIGFSGLWRNVVRFLSPISIVPLVALSGFGLYELGFPGVAKCVEIGLPELVLLVFCGQYLPQLIKPGKNIFERFAVLITVSIVWIYAHILTIGGAYDGASPQTQASCRTDHSGLISAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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