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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002032`

染色体: Chr04 坐标: 33003954-33009570 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002032`
名称	SmilChr04G002032
描述	calmodulin-binding protein 60 A-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	33003954 - 33009570 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021203`
GeneID	`131021203`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021203`
原始查询	`SmilChr04G002032`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	calmodulin-binding protein 60 A-like
产物	calmodulin-binding protein 60 A-like
Arabidopsis	`AT4G31000` (AT4G31000) Calmodulin-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829227] identity=29.9; qcov=0.569; evalue=1.18e-43; confidence=low
Rice	`Os02g0177800` - identity=29.9; qcov=0.754; evalue=3.09e-41; confidence=low
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005516 (calmodulin binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding); GO:0080142 (regulation of salicylic acid biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF07887 (Calmodulin_bind); PF20451 (Calmod_bind_M)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021203

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806286.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806286.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806286.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806286.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057806286.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:33004352`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C48
`Chr4:33004352`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C48
`Chr4:33004362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr4:33004370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr4:33004418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr4:33004488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,C47
`Chr4:33004547`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B58
`Chr4:33004547`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B58
`Chr4:33004570`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A25,B140,B44,B52,B86,C31,C84
`Chr4:33004625`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	32	A21,A22,A25,B104,B114,B123,B2,B23,B28,B33,B44,B52,B54,B59,B65,B8,B86,B87,B9,B90,B92,B94,C11,C14,C22,C31,C32,C45,C61,C84,D3,D9
`Chr4:33004630`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	33	A21,A22,A25,B104,B114,B123,B2,B23,B28,B33,B44,B52,B54,B59,B65,B76,B8,B86,B87,B9,B90,B92,B94,C11,C14,C22,C31,C32,C45,C61,C84,D3,D9
`Chr4:33004655`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	52	A14,A21,A22,A25,B100,B104,B114,B123,B125,B129,B2,B23,B25,B28,B33,B35,B44,B52,B54,B59,B65,B76,B77,B8,B86,B87,B9,B90,B92,B94,C11,C14,C16,C18,C22,C29,C31,C32,C41,C45,C48,C56,C61,C62,C67,C69,C77,C84,D10,D11,D3,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806286.1

617 aa

308

617

Calmodulin_bind

Calmod_bind_M

PF07887 Calmodulin_bind 92-232 aa PF20451 Calmod_bind_M 249-310 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806286.1`	Pfam	`PF07887`	Calmodulin_bind	Domain	92	232	1e-22	81.6	Calmodulin binding protein-like N-terminal domain
`XP_057806286.1`	Pfam	`PF20451`	Calmod_bind_M	Domain	249	310	8.7e-17	62.2	Calmodulin binding protein central domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950303.1
TGTACGGCTCCACAGACACGATGTTGTAGAGTGTAGAGGGTACACGCCATGGCCTCTCCCCAATCGCCGACGCGTTCTCCTCATTTCTGCATCTGCATGTATAAATACTTCAATTTCAGAGTATCTTCCCAAACTCACTTCAGGGACGAAAACAAAAGAAAAAAACATAAACATCAATCCTTGTTTTTTTCGGGGGAGAGCTTCAGCTGAAGCCGAAGATGGAGAATGGCGAAGATGGTGAAGGGGAGCACCCCGGCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021203
ATGGAGAATGGCGAAGATGGTGAAGGGGAGCACCCCGGCAGCGTAAATATTGGGCAATCTCTTTCTCTAAGAAAAATGATGGAAATTATTGAACCGGCAGTATTGAAAATTATTCCACGAGTATTGAAGCCTATGGTCATCAATGCTGTTCAGGAAGTAATAAGGCCGATTGTTGAGGTTTCATTACGTAAAGTGGTACAAGAGGAAATTCAAAAATTTGAAGAGAAGCTTTTGACTGGAGGGACTCGGAATGACTTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806286.1
MENGEDGEGEHPGSVNIGQSLSLRKMMEIIEPAVLKIIPRVLKPMVINAVQEVIRPIVEVSLRKVVQEEIQKFEEKLLTGGTRNDLPKERSLHLRFLDEAPDTVQTGNEIRGIKGEWLKLALCDASGHIVTCGRESSARVEIVLLDASGNDVENNTTPENFERRIIRAGDKEKPHFAKIVYVNLEKGVGILNGLKLGHGKDWTKLCNCRLGARILANFVVQEAWTRPFKVIDKRGKHYGKHNTPFHYSQVWRLNGIGRDG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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