当前解析结果
SmilChr04G002034| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002034 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002034 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G002034 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 33037597 - 33038454 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023323 |
|---|---|
| GeneID | 131023323 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023323 |
| 原始查询 | SmilChr04G002034 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=26; qcov=0.93; evalue=9.34e-22; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023323 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057808848.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057808848.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057808848.1 |
| 4 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.20000 | XP_057808848.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808848.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:33037611 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 8 | A1,B102,B54,B55,B72,C29,C71,D6 |
Chr4:33037616 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B131,B92 |
Chr4:33037627 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A6 |
Chr4:33037628 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A7,B104,C30,C33 |
Chr4:33037633 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A6 |
Chr4:33037662 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A11,B104,B99,C30,D9 |
Chr4:33037704 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B18 |
Chr4:33037725 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C15 |
Chr4:33037774 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
Chr4:33037775 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C82 |
Chr4:33037775 |
GA |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | C82 |
Chr4:33037783 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。