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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002045`

染色体: Chr04 坐标: 33187317-33189941 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002045`
名称	SmilChr04G002045
描述	uncharacterized SmilChr04G002045
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	33187317 - 33189941 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021214`
GeneID	`131021214`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021214`
原始查询	`SmilChr04G002045`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	armadillo repeat only 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829646]; symbol=ARO1; hit=AT4G34940; species=arabidopsis; confidence=high
产物	armadillo repeat only 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829646]; symbol=ARO1; hit=AT4G34940; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G34940` (ARO1) armadillo repeat only 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829646] identity=67.7; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0536200` - identity=61.6; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0007166 (cell surface receptor signaling pathway)
KEGG	-
Pfam	PF00514 (Arm); PF25055 (DUF7792)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021214

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057806297.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806297.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806297.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806297.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806297.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:33187573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B84,B9,B93,C62
`Chr4:33187628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr4:33187661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr4:33187671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B39,B85,C13
`Chr4:33187728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,B58,B66,C82
`Chr4:33187769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr4:33187795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr4:33187891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr4:33187987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B47,B53,C2,D7
`Chr4:33188163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:33188358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr4:33188365`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B137,B3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806297.1

655 aa

328

655

DUF7792

Arm

PF25055 DUF7792 6-121 aa PF00514 Arm 182-213 aa PF00514 Arm 217-257 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806297.1`	Pfam	`PF25055`	DUF7792	Domain	6	121	1.8e-47	161.1	Domain of unknown function (DUF7792)
`XP_057806297.1`	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	182	213	1.4e-21	76.4	Armadillo/beta-catenin-like repeat
`XP_057806297.1`	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	217	257	1.4e-21	76.4	Armadillo/beta-catenin-like repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950314.1
ATGCAATAGCTTGTTGCTTATAAATCGACGTTACTAGATATAGGAGTTGAAATAGGATTAGTCGAGCATGGGCAATTGGTTGATAGGTTTGCTACCAATATATATAAATGGAAGTAGTAATTAATTACTGATATGGGGAAATTGTAGTGTTTGGGAGTTTAAAGGTCGATGAAGCATCATCGTCCCTATTAATAAGGTTGTAACAGTCGCTCCTTTTTTCTGGTTTTAATGCAAAACAAAAAAACCACCACACAAACAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021214
ATGGCGGACATAGTGAAGCAGATCCTCGCGAAGCCGATCCAATATGCGGACGAGGTGATCAAGCTTGCGGATCAGGCAAGTTTCATGAAGGCGGAATGCGGGGAGATCAAGGTCAGGACGGAGAAGCTCGCCGGCCTCCTCCGCCAGGCCGCGCGAGCCAGCGGCGACCTCTACGAGCGCCCCACGCGCCGGATCATCGACGACACCGAGCAGGTCCTCGACAAGGCCCTCACCCTCGTCTTCAAGTGCCGCTCCAACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806297.1
MADIVKQILAKPIQYADEVIKLADQASFMKAECGEIKVRTEKLAGLLRQAARASGDLYERPTRRIIDDTEQVLDKALTLVFKCRSNGLRRIFTITPAAAFKKVQQQLDNSIGDVSWLLRVSAPADDRDDEYLGLPPIAANEPILCLIWEQIAILCSGGLEERADAAASLVSLARDNDRYGSLIIEEGGVPPLLKLLKEGRMEGQENAARAIGLLGRDPESVEHIVNAGVCQVVAKILKEGHMKVQIVVAWALSELAANHR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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