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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002074`

染色体: Chr04 坐标: 33485248-33486151 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002074`
名称	SmilChr04G002074
描述	uncharacterized SmilChr04G002074
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	33485248 - 33486151 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023329`
GeneID	`131023329`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023329`
原始查询	`SmilChr04G002074`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861]; symbol=AT2G13770; hit=AT2G13770; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861]; symbol=AT2G13770; hit=AT2G13770; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=44.8; qcov=0.817; evalue=6.55e-39; confidence=medium
Rice	`Os01g0872900` - identity=61; qcov=0.362; evalue=1.82e-25; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023329

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808856.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808856.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808856.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808856.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808856.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:33485250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B57,C32,C68
`Chr4:33485253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B95,C71,D3
`Chr4:33485257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B87,C26,D10,D11,D9
`Chr4:33485269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B64,B66,B88,D3
`Chr4:33485282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B87,C26,D10,D11,D9
`Chr4:33485305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B100,B113,B35,B46,C27,C48,C7
`Chr4:33485311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,B47,D1
`Chr4:33485321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B44,C19
`Chr4:33485342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,C77
`Chr4:33485350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	24	A15,A16,A8,B101,B108,B112,B115,B127,B15,B16,B20,B25,B37,B39,B74,B8,B99,C19,C40,C44,C48,C72,C78,C85
`Chr4:33485360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr4:33485362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,B88

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808856.1

213 aa

106

213

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 74-146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808856.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	74	146	1.2e-21	78.0	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952873.1
ATGAGCCGGGAGTTGTTTCTACGCATTGTCAATGCGCTAGAAGTCGATCCTTACTTCCAACAACGTCAGGATGCTGTTGGCCGCTTAAGCTTCTCCCCGATCCAGAAGTGCACTGCCGCTGTTCGACAATTGGCATACGGAACTTCTGCTGATTGTTGTGACGAATATCTCCGTATAGGAGAGTCGACGGCGTTGGAATGCTTGAAGAAATTCTGCAAGGCCGTCGTTCCGGGGCATGAAGTGGCTGTGCACTTCCTCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023329
ATGAGCCGGGAGTTGTTTCTACGCATTGTCAATGCGCTAGAAGTCGATCCTTACTTCCAACAACGTCAGGATGCTGTTGGCCGCTTAAGCTTCTCCCCGATCCAGAAGTGCACTGCCGCTGTTCGACAATTGGCATACGGAACTTCTGCTGATTGTTGTGACGAATATCTCCGTATAGGAGAGTCGACGGCGTTGGAATGCTTGAAGAAATTCTGCAAGGCCGTCGTTCCGGGGCATGAAGTGGCTGTGCACTTCCTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808856.1
MSRELFLRIVNALEVDPYFQQRQDAVGRLSFSPIQKCTAAVRQLAYGTSADCCDEYLRIGESTALECLKKFCKAVVPGHEVAVHFLANNSHHTRGYYLTDGIYPDWPVFVKSFQFSNDEKKRRFKEMQEAARKDVERAFGVLQARWGGNASNFDGDDGEGPSSTPQTQFNSGAPPEFAAYLARNASLKDARLHARLRDDLVEHIWARFGPVDP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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