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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002096`

染色体: Chr04 坐标: 33783651-33788648 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002096`
名称	SmilChr04G002096
描述	protein EARLY FLOWERING 5
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	33783651 - 33788648 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021262`
GeneID	`131021262`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021262`
原始查询	`SmilChr04G002096`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein EARLY FLOWERING 5
产物	protein EARLY FLOWERING 5
Arabidopsis	`AT5G62640` (ELF5) proline-rich family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836385] identity=68.8; qcov=0.34; evalue=1.46e-71; confidence=low
Rice	`Os07g0192900` - identity=83.8; qcov=0.299; evalue=7.53e-77; confidence=weak
GO	GO:0005681 (spliceosomal complex); GO:0045292 (mRNA cis splicing, via spliceosome)
KEGG	-
Pfam	PF09429 (Wbp11); PF12622 (NpwBP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021262

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806355.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057806355.1`
3	Nuclear speckle	核斑点	0.80000	`XP_057806355.1`
4	Chromatin	染色质	0.20000	`XP_057806355.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057806355.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:33784012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C23,C35
`Chr4:33784112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:33784705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr4:33785290`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,B54,C23
`Chr4:33785295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:33785537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:33785542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B76,C49,C82,D11
`Chr4:33785955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,B54,C23,C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806355.1

538 aa

269

538

Wbp11

NpwBP

PF09429 Wbp11 8-84 aa PF12622 NpwBP 127-160 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806355.1`	Pfam	`PF09429`	Wbp11	Family	8	84	1.9e-23	83.4	WW domain binding protein 11
`XP_057806355.1`	Pfam	`PF12622`	NpwBP	Domain	127	160	3.2e-08	34.7	mRNA biogenesis factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950372.1
AAAGTGAGAATGCTCTAATAAGTTACTTGCTAAATCTCCGGACTCCCGAGGGAAAAACAAGAAAAAATACGTATTTATCCATTTTGATCCTATATTCAAAACTCATCAAAATTTAAAATAGATTAAAACAAACAGCGATTCACCGATCCAATAACTCGCCCATAACTCGTTCCGGAATACCCAGAAATTAATTTTTAGGGCGAGCCCTTTCTCCTTCATCCCCAAATCGCTAAACCTTCTGTACAATTACTCGATTGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021262
ATGGTGAAGACGACGAAGGGAGGCAAAACCATGAACCCTACCGATGCATACCGCAAGGAGCTGCGCAAGAAGGAATTGAAGCGGAACAAGAAGGAGAGGAAGAAGGTAAGGGAAGTTGGAATTTTGAAGAAGGATCCGGACACTCTGAAAGATCAGATTCAGAAGCTGGAAGCAATGAAGGCAGATGGTGCTCTGGACAAAGCTAGAAAACACAAAAAAAGACAACTCGAAGACACACTCAATCTTGTGCTCAAAAAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806355.1
MVKTTKGGKTMNPTDAYRKELRKKELKRNKKERKKVREVGILKKDPDTLKDQIQKLEAMKADGALDKARKHKKRQLEDTLNLVLKKRKEYEEKMKEKGEAPVMFSHLGPVRRRATAEEEERVKHPRPEDSVYYHPTLNPSGAPPPGKPPMFKSSIGPRIPLPESSASNVASSLQSETEDGTLPVPPPPPPLPGVGLDSGEGATLPVSLPLPPPPPMPPNPAVGDSTSSLPPPPLPPPPPPPGPPPKELLAVRPPLPPPPP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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