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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002097`

染色体: Chr04 坐标: 33807836-33814671 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002097`
名称	SmilChr04G002097
描述	zinc finger protein BRUTUS-like At1g74770
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	33807836 - 33814671 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021263`
GeneID	`131021263`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021263`
原始查询	`SmilChr04G002097`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger protein BRUTUS-like At1g74770
产物	zinc finger protein BRUTUS-like At1g74770
Arabidopsis	`AT1G74770` (AT1G74770) zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843816] identity=47; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0551000` (OsHRZ2) - identity=62.9; qcov=0.251; evalue=2.51e-140; confidence=weak
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01814 (Hemerythrin); PF05495 (zf-CHY); PF13639 (zf-RING_2); PF14599 (zinc_ribbon_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021263

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057806356.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057806356.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806356.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806356.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806356.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:33809758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B76,C49,C82,D11
`Chr4:33809799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,A8,C63,C87
`Chr4:33809948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr4:33810077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr4:33810441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C30,C39,C75
`Chr4:33811988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B46,B62,B67,B98,C80
`Chr4:33812408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr4:33812475`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr4:33812834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr4:33813062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B8,B90,C31
`Chr4:33813273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,B86
`Chr4:33813984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806356.1

1237 aa

618

1237

Hemerythrin

zf-CHY

zf-RING_2

zinc_ribbon_6

PF01814 Hemerythrin 30-163 aa PF05495 zf-CHY 1001-1070 aa PF13639 zf-RING_2 1129-1172 aa PF14599 zinc_ribbon_6 1178-1235 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806356.1`	Pfam	`PF01814`	Hemerythrin	Domain	30	163	8e-16	59.4	Hemerythrin HHE cation binding domain
`XP_057806356.1`	Pfam	`PF05495`	zf-CHY	Domain	1001	1070	1.1e-16	61.6	CHY zinc finger
`XP_057806356.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	1129	1172	1.9e-07	32.0	Ring finger domain
`XP_057806356.1`	Pfam	`PF14599`	zinc_ribbon_6	Domain	1178	1235	1.3e-23	83.5	Zinc-ribbon

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950373.1
AACGTCGGGGTCGTTGGAATTGTTTAGAAAGCTAATTTTTAAACAAAAACCGAATTAAATAAGTTTGAATCTGTGATGAAGGCAGCACACGCACGGCCTGAATCCCCATTAAATTGCAGCTCAATCCTGCCGTGGAGAACTCCCTTTTTTGGTCCCTCGCGCCATTGATGAAAGGTGGTGGTCTCGGCGACGGCGTCTTGTCGTTAAATGGGCGGCGGGGAATCCGAGAAGGAGGAGGACTGGCCGGAGCCTTCGTTTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021263
ATGGGCGGCGGGGAATCCGAGAAGGAGGAGGACTGGCCGGAGCCTTCGTTTGCCGGGGCCAGACTGGTTGACGCGCCCATTCTCTTCTTCGTGGTTACTCACAAGGCTTTCCGTGCGGAGCTCGATTTCGTCCGCCGTGTGGCGGCTGAGGCCTCCGAGGGCGGCGCTGTGAGCGGCGCAGTTGTCGTTGACCTTAGCCGGAGGCTGGAGTTTTTGAAGCTTGTGTATGATTACCACAGTGTTGCGGAAGACGAGGTTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806356.1
MGGGESEKEEDWPEPSFAGARLVDAPILFFVVTHKAFRAELDFVRRVAAEASEGGAVSGAVVVDLSRRLEFLKLVYDYHSVAEDEVIFLALDAQVKNVVPTYSLEHSSIDDSFSCIFHYLDLLMNKDEDAPEMFQDLISLIGTVQTMICHHMHKEEEQVFPLLMEKCSREEQSQLIWQYMCSVPTILLEEFLPWMTLYLSTDEKVDVLHCIKLIVPKERLLQEVVVSWIQHESSSSGANSIYGKRHQLLTGLSNRDIHKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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