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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002099`

染色体: Chr04 坐标: 33849332-33861292 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002099`
名称	SmilChr04G002099
描述	uncharacterized SmilChr04G002099
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	33849332 - 33861292 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021265`
GeneID	`131021265`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021265`
原始查询	`SmilChr04G002099`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823944]; symbol=AT3G47890; hit=AT3G47890; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823944]; symbol=AT3G47890; hit=AT3G47890; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G47890` (AT3G47890) Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823944] identity=52.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0165600` - identity=67.4; qcov=0.228; evalue=2.37e-162; confidence=weak
GO	GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0016579 (protein deubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF00443 (UCH); PF04780 (DUF629); PF04781 (DUF627)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021265

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057806359.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057806359.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057806359.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806359.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806359.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:33852157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr4:33854442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:33854456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,C48,C61
`Chr4:33857170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr4:33857770`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,B69,C62
`Chr4:33857857`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B2,B47,D7
`Chr4:33857904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr4:33858777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr4:33858817`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr4:33859077`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B4
`Chr4:33859077`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B4
`Chr4:33859239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806359.1

1576 aa

788

1576

DUF627

DUF629

UCH

PF04781 DUF627 83-193 aa PF04780 DUF629 354-890 aa PF00443 UCH 1251-1550 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806359.1`	Pfam	`PF04781`	DUF627	Family	83	193	8.4e-33	113.3	Protein of unknown function (DUF627)
`XP_057806359.1`	Pfam	`PF04780`	DUF629	Family	354	890	2.5e-136	455.7	Protein of unknown function (DUF629)
`XP_057806359.1`	Pfam	`PF00443`	UCH	Family	1251	1550	3e-27	96.6	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950376.1
AAAATTCACACCAAAGTCAGTGTTTGGTGTTCATCTTCAACCCCAACTGGTTTGGTGTGTTCTTATTTCACACACAACACACACTATCCATCCCTACTCACACACACGCACTGACGCACATCTATATGTATATATCTCCATGTATCTCTGGTACGCGCGCCTCCCCTTAAATCGCTCTGCTTCTAGATTTCTCTGCGTGTGTGTGTGAGCCGCTCTGCGTGTGTGTGTGCTGAATAGTTGTTACTTTTATACAGTATATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021265
ATGGGGCACAAGAAGCGGAACGCCGCTCCTCGCTCCAAAAAACCTTCGCAGCTGCCGGCGGCGGCGGCGGATATCGCATCTTCCAACGGCGCCGCTGCTATCGTCGATTGCTCCCTTTCAGGCCTCGACCAATCCGCGGAATCCATCAACGGAACATCTGTTAAATCAGAGGCCACGATTCCAGAAAGCAATAACAATGTAGTTACGTCTGCATCATATGCTTCGGTAAAGCTCGAGTGCGAACGGGCTCTCACGGCGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806359.1
MGHKKRNAAPRSKKPSQLPAAAADIASSNGAAAIVDCSLSGLDQSAESINGTSVKSEATIPESNNNVVTSASYASVKLECERALTALRRGNHTKALRLMKDLCCKHENSPHSALIHRVQGTVCVKVSSIIDDSNVKQRHVRNAIESARRAVSLSPSSVEFAHFYANLLYEAANDAKEYEEVMQECERALAIENPVDPAKENLQEESQQKISTAEARVSHVQGELKALIQKANIASISSWMKNLGNGDDKLQFIPLRRAPE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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