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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002123`

染色体: Chr04 坐标: 34245234-34247244 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002123`
名称	SmilChr04G002123
描述	probable polygalacturonase At3g15720
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	34245234 - 34247244 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023342`
GeneID	`131023342`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023342`
原始查询	`SmilChr04G002123`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable polygalacturonase At3g15720
产物	probable polygalacturonase At3g15720
Arabidopsis	`AT3G15720` (AT3G15720) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820815] identity=45; qcov=1.01; evalue=6.65e-107; confidence=medium
Rice	`Os05g0542800` (OsPGL9) - identity=40.8; qcov=0.97; evalue=4.94e-102; confidence=medium
GO	GO:0004650 (polygalacturonase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00295 (Glyco_hydro_28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023342

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057808868.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057808868.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057808868.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808868.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808868.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:34245282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr4:34245284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:34245305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C57
`Chr4:34245561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B24,B32,C25
`Chr4:34245654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr4:34246066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B89
`Chr4:34246072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr4:34246095`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B46,B75
`Chr4:34246096`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr4:34247010`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B59,B86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808868.1

394 aa

197

394

Glyco_hydro_28

PF00295 Glyco_hydro_28 52-374 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808868.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	52	374	1e-82	278.5	Glycosyl hydrolases family 28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952885.1
ATGAGAAACTCATTCAGCTTGTTAACTTTCTTTCTTGTTTGTTATCCAGTCGTAACAGCTTCGACACTAGTCTTCAACGTTATTGATTATGGAGCAGTTGGCAATGGACTAGCAGATGATACAAATGCTTTTGCAAAAGCATGGGAAGAAACATGCGCATCTTCTTCGTCTCCGACCATGAAAGTTCCTTCAGACAGCACATTCTTGGTTCAGCCGCTGCGCTTCATCGGCCCTTGCAAATCACGCTCTCTCACCCTCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023342
ATGAGAAACTCATTCAGCTTGTTAACTTTCTTTCTTGTTTGTTATCCAGTCGTAACAGCTTCGACACTAGTCTTCAACGTTATTGATTATGGAGCAGTTGGCAATGGACTAGCAGATGATACAAATGCTTTTGCAAAAGCATGGGAAGAAACATGCGCATCTTCTTCGTCTCCGACCATGAAAGTTCCTTCAGACAGCACATTCTTGGTTCAGCCGCTGCGCTTCATCGGCCCTTGCAAATCACGCTCTCTCACCCTCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808868.1
MRNSFSLLTFFLVCYPVVTASTLVFNVIDYGAVGNGLADDTNAFAKAWEETCASSSSPTMKVPSDSTFLVQPLRFIGPCKSRSLTLQIDGNLVAPAHPSTWKCDANLCHQWLYFHRVDGLTLRGRGTIDGRGHKWWQNKHLNRPTVMEISNADNVRVGGGLRFKDSPMMHIVLNGIQSVFVSDVTVEAPAKSPNTDGIHVQDSTNAQIHNCTIGTGDDCIAIVNGASNVRISNIVCGPGHGISIGSLGKNGAEDKVEDVR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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