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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002129`

染色体: Chr04 坐标: 34265602-34277016 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002129`
名称	SmilChr04G002129
描述	isochorismate synthase, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	34265602 - 34277016 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021283`
GeneID	`131021283`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021283`
原始查询	`SmilChr04G002129`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	isochorismate synthase, chloroplastic-like
产物	isochorismate synthase%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G18870` (ICS2) isochorismate synthase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838468] identity=57.2; qcov=0.984; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0361500` (ICS1) - identity=56.4; qcov=0.942; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008909 (isochorismate synthase activity); GO:0009536 (plastid); GO:0042372 (phylloquinone biosynthetic process)
KEGG	smil00130 (Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00425 (Chorismate_bind); PF30495 (Chorismate_bind_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021283

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057806391.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057806391.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806391.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806391.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806391.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:34266741`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A22,B131,B76,C23,C49,D10,D11
`Chr4:34266745`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A22,B131,B76,C23,C49,D10,D11
`Chr4:34267553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:34267555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr4:34267790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr4:34267933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B69,D7
`Chr4:34267944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr4:34267972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr4:34268413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr4:34268932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,C23,D10
`Chr4:34269907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr4:34269972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806391.1

565 aa

282

565

Chorismate_bind_2

Chorismate_bind

PF30495 Chorismate_bind_2 97-548 aa PF00425 Chorismate_bind 178-547 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806391.1`	Pfam	`PF30495`	Chorismate_bind_2	Domain	97	548	3.7e-94	317.0	Chorismate binding enzyme
`XP_057806391.1`	Pfam	`PF00425`	Chorismate_bind	Domain	178	547	2.3e-70	238.8	chorismate binding enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950408.1
CATATATACTCTTTCCAAACTCATAAATCACACACACTAAAAAAACATGGCTGTTGGTACAACTAGACAATGCATTGGCCGTTTCATGGACATTGAGCCCATGAAATTTTCTTTCTCATCCCCAACTGCAATTGCAAGACAATCAGTCCATCTCCCCAATCATAAATATCAAGAACTCAGCTCCTTGTCCATGAATGGCTGCGGCGGCGATCCTCGAGCCCCTCTCGGCGTCGTCGAGACCCGGACGCTCGCCGCCGTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021283
ATGGCTGTTGGTACAACTAGACAATGCATTGGCCGTTTCATGGACATTGAGCCCATGAAATTTTCTTTCTCATCCCCAACTGCAATTGCAAGACAATCAGTCCATCTCCCCAATCATAAATATCAAGAACTCAGCTCCTTGTCCATGAATGGCTGCGGCGGCGATCCTCGAGCCCCTCTCGGCGTCGTCGAGACCCGGACGCTCGCCGCCGTGCCCACTCTGGCCGTGGCCGCCGACCGCCTCAACTCCGTCGTTTACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806391.1
MAVGTTRQCIGRFMDIEPMKFSFSSPTAIARQSVHLPNHKYQELSSLSMNGCGGDPRAPLGVVETRTLAAVPTLAVAADRLNSVVYDLKTCSPTSDSGIIRIEVPIQQQIEALEWLHCQTHTLLPRCYFSGRDSGDIPLIDHGDGNGNDSQQKLVSVAGLGSAVSFRHLRPFSLDDWHSIKRFLSKKCPLIRAYGAIRFDARSNIAPEWEGFGSFYFMVPQVEFNEFEGSSMIAATIAWDNRLSRTYEEAIAALEATMWQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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