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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002143`

染色体: Chr04 坐标: 34447110-34449426 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002143`
名称	SmilChr04G002143
描述	uncharacterized SmilChr04G002143
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	34447110 - 34449426 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021301`
GeneID	`131021301`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021301`
原始查询	`SmilChr04G002143`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Galactose mutarotase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823934]; symbol=AT3G47800; hit=AT3G47800; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Galactose mutarotase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823934]; symbol=AT3G47800; hit=AT3G47800; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G47800` (AT3G47800) Galactose mutarotase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823934] identity=65.8; qcov=1.01; evalue=1.34e-171; confidence=high
Rice	`Os03g0381000` (RMP9) - identity=53.3; qcov=0.935; evalue=6.01e-125; confidence=high
GO	GO:0004034 (aldose 1-epimerase activity); GO:0006006 (glucose metabolic process); GO:0030246 (carbohydrate binding); GO:0033499 (beta-D-galactose catabolic process via UDP-galactose, Leloir pathway)
KEGG	smil00010 (Glycolysis / Gluconeogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00052 (Galactose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01263 (Aldose_epim)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021301

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057806412.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057806412.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057806412.1`
4	Lysosome	溶酶体	0.20000	`XP_057806412.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806412.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:34447477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr4:34447527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B25,B33,C23,D11
`Chr4:34447541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B65
`Chr4:34447587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,B65,C11,C57,C69
`Chr4:34448394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr4:34449003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr4:34449096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr4:34449192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B76,C49
`Chr4:34449208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B18,B44,B52,B69,D7
`Chr4:34449314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:34449362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806412.1

355 aa

178

355

Aldose_epim

PF01263 Aldose_epim 30-351 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806412.1`	Pfam	`PF01263`	Aldose_epim	Family	30	351	2.4e-89	300.4	Aldose 1-epimerase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950429.1
AAATGAAAGCAGCAGTTTGTCTTTCCCAAAAATCTTCTAGATGAAATAGCTCCCATTTATTTCGAGAAGATCCACACAGGACTCATGCCGTCTGTTTCAATTACTCTCTCACACACACACGCACAGAAATCCTTATCGACAATGAACCTTCTTCTGTAATATCCGCACCTCATTTTTCCTCAACTCAAACCACATTTTTCTCTATCCATTTAATTTTGTGTTTGTATATATATATAAGTGTGTGTGTGTGTGATACTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021301
ATGGACAAAGCACCTTTGTATTTGTGTGTGATGATGATAGCTTTTGCAGTAAGCAACGTGTGTGAAGCTGCTCCTGAAATTGGCGTATTTGAACTGCGGAAAGGTGATTTCTCCGTCAACATCACCAACTATGGCGCCACCGTTATCTCCGTCCTAGTCCCCGATCGGAATGGCAAGTTGGATGACATAGTTCTCGGTTTTGGATCCGTAGAAGGTTACAAGAATGATACAACCTACTTTGGTGCCCTAGTCGGGCGCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806412.1
MDKAPLYLCVMMIAFAVSNVCEAAPEIGVFELRKGDFSVNITNYGATVISVLVPDRNGKLDDIVLGFGSVEGYKNDTTYFGALVGRVANRISGAQFTLNGVVYKLPDNNNGNTLHGGKIGFSDVVWTVQEHVKNSHITLTYNSHDGEQGFPGAVFVMVTYLFIGSNKFAIKMEAKPLNKPTPINLASHTYWNLGGHANGNILSHKIQLLASKITPVDDRLIPTGAISSVKGTPYDFLRPRAIGSRLNEVAGGYDINYVLD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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