当前解析结果
SmilChr04G002147| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002147 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002147 |
| 描述 | transcription factor ILI3-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 34524384 - 34525553 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131021305 |
|---|---|
| GeneID | 131021305 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021305 |
| 原始查询 | SmilChr04G002147 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | transcription factor ILI3-like |
| 产物 | transcription factor ILI3-like |
| Arabidopsis | AT3G28857 (PRE5)basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745895] identity=47.8; qcov=1.03; evalue=1.12e-19; confidence=low |
| Rice | Os10g0403800 (OsBUL3)- identity=46.1; qcov=1; evalue=1.17e-19; confidence=low |
| GO | GO:0046983 (protein dimerization activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00010 (HLH); PF23174 (bHLH_ILI) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021305 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057806419.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057806419.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057806419.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057806419.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057806419.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057806419.1PF23174
bHLH_ILI 12-86 aa
PF00010
HLH 14-56 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057806419.1 |
Pfam | PF23174 |
bHLH_ILI | Domain | 12 | 86 | 6e-18 | 65.7 | ILI bHLH domain |
XP_057806419.1 |
Pfam | PF00010 |
HLH | Domain | 14 | 56 | 1.4e-07 | 31.9 | Helix-loop-helix DNA-binding domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。