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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002149`

染色体: Chr04 坐标: 34546756-34547922 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002149`
名称	SmilChr04G002149
描述	protein FAR-RED IMPAIRED RESPONSE 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	34546756 - 34547922 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023347`
GeneID	`131023347`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023347`
原始查询	`SmilChr04G002149`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR-RED IMPAIRED RESPONSE 1-like
产物	protein FAR-RED IMPAIRED RESPONSE 1-like
Arabidopsis	`AT4G15090` (FAR1) FRS (FAR1 Related Sequences) transcription factor family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827173] identity=29.7; qcov=1.1; evalue=6.28e-50; confidence=low
Rice	`Os11g0681300` - identity=42.4; qcov=0.863; evalue=1.4e-77; confidence=medium
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023347

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808871.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057808871.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808871.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808871.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808871.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:34546762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B38
`Chr4:34546762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38
`Chr4:34546774`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	19	A20,A21,A24,B1,B120,B124,B14,B19,B53,B58,B63,B66,B79,C11,C2,C36,C50,C69,D5
`Chr4:34546812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:34546825`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	87	A10,A13,A2,A21,A25,A3,A4,A6,B100,B102,B106,B107,B110,B111,B114,B118,B120,B122,B123,B125,B126,B131,B134,B135,B136,B137,B140,B20,B22,B24,B33,B37,B38,B40,B41,B42,B43,B46,B49,B5,B59,B61,B63,B65,B67,B70,B71,B75,B77,B80,B86,B9,B90,B92,C1,C10,C12,C14,C25,C28,C29,C3,C30,C33,C37,C42,C45,C46,C47,C49,C50,C56,C57,C63,C69,C7,C70,C72,C73,C76,C78,C79,C83,C84,C86,D3,D5
`Chr4:34546880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:34546887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C57
`Chr4:34546888`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B59,C57
`Chr4:34546934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr4:34546964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C57
`Chr4:34546969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:34547004`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	57	A10,A25,A3,A4,A6,B100,B101,B102,B107,B110,B114,B115,B118,B120,B121,B123,B125,B126,B135,B137,B139,B20,B33,B37,B41,B42,B46,B49,B53,B61,B67,B70,B71,B75,B77,B8,B80,B83,B9,C10,C11,C12,C28,C29,C49,C52,C56,C57,C63,C69,C72,C76,C83,C86,C87,D3,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808871.1

342 aa

171

342

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 165-283 aa PF10551 MULE 202-295 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808871.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	165	283	3.2e-07	31.0	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057808871.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	202	295	2.3e-29	102.3	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952888.1
ATGGAACAAAATGAAGACGATGCACTTGAAGTTTTATGCCTAAATGAAGAAGAGCAGATGGAAGTAGAATCCCAAGAGATTGATATGCGAGCAATCAACGACATGTTGCAAAATGGTCCTCAATCTAGAATGGAATTTCAAAGTAGGGAATGTCTCTTTGCAGCATATCAAGAGTATGCAAAGCATAAAGGGTTCAGTGTATCAACTAGAAATGTACAAAAAGAGAAATATCTCATGATCTCATGTGATAGGGGCCGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023347
ATGGAACAAAATGAAGACGATGCACTTGAAGTTTTATGCCTAAATGAAGAAGAGCAGATGGAAGTAGAATCCCAAGAGATTGATATGCGAGCAATCAACGACATGTTGCAAAATGGTCCTCAATCTAGAATGGAATTTCAAAGTAGGGAATGTCTCTTTGCAGCATATCAAGAGTATGCAAAGCATAAAGGGTTCAGTGTATCAACTAGAAATGTACAAAAAGAGAAATATCTCATGATCTCATGTGATAGGGGCCGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808871.1
MEQNEDDALEVLCLNEEEQMEVESQEIDMRAINDMLQNGPQSRMEFQSRECLFAAYQEYAKHKGFSVSTRNVQKEKYLMISCDRGRKPNVIKHLSNNMKRQLEARDMAGIRVCKNIRLLEVLAGGPSSLGASVKDCRNFIDQRRRLRLAEGDAAAIYNLFKRLQQQDRNFFHLMDLDDDNRLRNVMWIHPRSRAAYEEFHDVVSFDTTYLVNQYNMPFGTVVGVNHHNQSILLGCALFTNEHAESFKWFFTNWLDAMEGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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