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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002150`

染色体: Chr04 坐标: 34551903-34552906 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002150`
名称	SmilChr04G002150
描述	pectinesterase 3
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	34551903 - 34552906 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021308`
GeneID	`131021308`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021308`
原始查询	`SmilChr04G002150`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectinesterase 3
产物	pectinesterase 3
Arabidopsis	`AT3G47670` (AT3G47670) Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823921] identity=35.4; qcov=1.02; evalue=5.8e-30; confidence=medium
Rice	`Os10g0185400` - identity=27.6; qcov=0.86; evalue=9.26e-14; confidence=low
GO	GO:0004857 (enzyme inhibitor activity)
KEGG	-
Pfam	PF04043 (PMEI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021308

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057806423.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806423.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806423.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806423.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806423.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:34552044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:34552116`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C79
`Chr4:34552116`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C79
`Chr4:34552122`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:34552178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:34552181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr4:34552196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:34552267`	`C`	`CT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	26	A4,A9,B105,B135,B14,B15,B23,B36,B42,B43,B46,B78,B98,C19,C30,C31,C33,C35,C37,C43,C45,C46,C7,C73,C74,C80
`Chr4:34552337`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A3,B137,B80,C41
`Chr4:34552337`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A3,B137,B80,C41
`Chr4:34552412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:34552425`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806423.1

236 aa

118

236

PMEI

PF04043 PMEI 77-220 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806423.1`	Pfam	`PF04043`	PMEI	Domain	77	220	2.5e-26	93.4	Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950440.1
CTTCAAAAATCAAAATAATTTGCATCTCTTCTAACAAAAATACCCAATTTGCAAAACCACCATTAACGAACCTCTCCTTTTCACTTTCCTCTTGAAACCCTAATCATGGAATTGATCAACTTCGCCAAAGGCTATGGCAAAGTCAACCCCGCAGAAGCAGAAGACAATCCCCCCGACTCCCCACCAAACCACCAGCGGCGGCGCATCATCGCCTTCTCTCTCGCCGTCTTCCTCACCCTCACCATCACCATCACTTCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021308
ATGGAATTGATCAACTTCGCCAAAGGCTATGGCAAAGTCAACCCCGCAGAAGCAGAAGACAATCCCCCCGACTCCCCACCAAACCACCAGCGGCGGCGCATCATCGCCTTCTCTCTCGCCGTCTTCCTCACCCTCACCATCACCATCACTTCTCTCATCACCGTTCTCATCCACGAGTCCGCCGCCGAGTCGGAACCGTCGCAACTCGCCTCCAACTCCGCCGATCCCCTCAAAACCGTCTGCTCGGTAACTCGGTACCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806423.1
MELINFAKGYGKVNPAEAEDNPPDSPPNHQRRRIIAFSLAVFLTLTITITSLITVLIHESAAESEPSQLASNSADPLKTVCSVTRYPNSCFSSISPLNSPPSNNPLQFFNLSLHASLLEVSSLKSQLPEPNTEPAMKDCAELFDGAASQLGRSAELICVGPGEEVLTEMRISDLQTWISAALTDLDTCLDGLAEMGSTAVGEWKLKVQKAKEYISNTLAILTNIRSLSQKFGLAMP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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