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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002155`

染色体: Chr04 坐标: 34606224-34608491 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002155`
名称	SmilChr04G002155
描述	60S ribosomal protein L7-2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	34606224 - 34608491 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021311`
GeneID	`131021311`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021311`
原始查询	`SmilChr04G002155`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L7-2-like
产物	60S ribosomal protein L7-2-like
Arabidopsis	`AT2G01250` (AT2G01250) Ribosomal protein L30/L7 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814652] identity=83.8; qcov=0.984; evalue=1.73e-148; confidence=high
Rice	`Os04g0605900` (rpl7) - identity=78.1; qcov=0.967; evalue=6.02e-137; confidence=high
GO	GO:0000463 (maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00327 (Ribosomal_L30); PF08079 (Ribosomal_L30_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021311

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057806426.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057806426.1`
3	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057806426.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057806426.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806426.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:34607119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:34607138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B87,C57,C78,D9
`Chr4:34607830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,A5,B121,B48,B81
`Chr4:34607838`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B46
`Chr4:34607838`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B46
`Chr4:34607842`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B46
`Chr4:34607842`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B46
`Chr4:34607860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C48
`Chr4:34607989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C48
`Chr4:34608313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806426.1

245 aa

122

245

Ribosomal_L30_N

Ribosomal_L30

PF08079 Ribosomal_L30_N 11-82 aa PF00327 Ribosomal_L30 87-137 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806426.1`	Pfam	`PF08079`	Ribosomal_L30_N	Domain	11	82	1e-21	77.7	Ribosomal L30 N-terminal domain
`XP_057806426.1`	Pfam	`PF00327`	Ribosomal_L30	Domain	87	137	5.8e-18	65.2	Ribosomal protein L30p/L7e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950443.1
AGATCTTCGGCCTTAAGGCCCATTAACTGAGTTTATTGATTTTAGAAATTCATGCAATCCGTTTAGGCAAAGCCCACTAAGAGCAAAGCCTACTTATAAATGGAGATGACCTAGGGTTTCGGTTTTGCACATCACTCTTGCTGTCCGTTTGCAGAAAATCCTAGCTTTTCGTGAACTCATCTGAGATGGGCGAGGATGTTAAAAGTGGGGTCATAGTCCCCGAGTCTGTATTGAAGAAGCTGAAGAGGGCTGAGGAATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021311
ATGGGCGAGGATGTTAAAAGTGGGGTCATAGTCCCCGAGTCTGTATTGAAGAAGCTGAAGAGGGCTGAGGAATGGTCCCTAGCAAGCACGAAAGAGCAAGAAGAAGCCAAGAAGAAGAAAGCTGAAACTCGAATGTTGATTTGCCAAAGAGCGAGGCAGTACTCACAGGAGTACGAGGACCAGGAGAAGGAGTTAATTATGCTGAAACGTGAAGCGAGATTGAAGGGTGGATTTTATGTGGACCCTGAAGCAAAACTTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806426.1
MGEDVKSGVIVPESVLKKLKRAEEWSLASTKEQEEAKKKKAETRMLICQRARQYSQEYEDQEKELIMLKREARLKGGFYVDPEAKLLFIVRIRGINAMHPTTKKILQLLRLRQIFNGVFLKVNKATMNMLHRVEPYVTYGYPNLKSVKELIYKRGFGKVNKQRIALTDNSIINQVLGKYGIICMEDLIHEILTVGPHFKEANNFLWPFQLKAPLGGLKKKRNHYVEGGDAGNRENFINELIRRMN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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