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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002161`

染色体: Chr04 坐标: 34789902-34793444 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002161`
名称	SmilChr04G002161
描述	protein SMAX1-LIKE 4-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	34789902 - 34793444 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021315`
GeneID	`131021315`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021315`
原始查询	`SmilChr04G002161`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SMAX1-LIKE 4-like
产物	protein SMAX1-LIKE 4-like
Arabidopsis	`AT4G29920` (AT4G29920) Double Clp-N motif-containing P-loop nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829115] identity=37.8; qcov=1.19; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os04g0298700` (OSJNBa0035B13.5) - identity=32.4; qcov=1.22; evalue=2.5e-117; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02861 (Clp_N); PF23569 (NBD_SMAX1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021315

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806430.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057806430.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057806430.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806430.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806430.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:34790255`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr4:34790324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr4:34790360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B119,B13
`Chr4:34790633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B61,B72,B8,C60,C80
`Chr4:34790871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B70,B8,C60,C65
`Chr4:34790893`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B126
`Chr4:34790893`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B126
`Chr4:34791456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B23
`Chr4:34792165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:34792231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr4:34792634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B87,D10,D9
`Chr4:34792637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806430.1

888 aa

444

888

Clp_N

NBD_SMAX1

PF02861 Clp_N 12-112 aa PF23569 NBD_SMAX1 203-377 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806430.1`	Pfam	`PF02861`	Clp_N	Family	12	112	3.4e-10	40.9	Clp repeat (R) N-terminal domain
`XP_057806430.1`	Pfam	`PF23569`	NBD_SMAX1	Domain	203	377	2.8e-62	210.8	SMAX1 nucleotide binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950447.1
GAAATGAAAAAAAAGGCGAAAAGGCGAAAGAGCCCTGGAAGAAAGAGAGAAACTCCAAGACAACCAGGATAGTAATAGCCTATTTATGTCCTTTCGAAGGCATTCGATTTGAAAAACCCCAGCTTGAAAGCTGATATCATAATTGTGAGATTGAGAGAGACGAAGCGGTAAGGGGGGGCTTTGTGAAGATAGATACACAGCTACATATTTACAATAGGGAAGCAATCTGTACGACCGGGGGGGTGTAGGGGGGTGGGGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021315
ATGCGTGCAGGAGGCTGTGCAGCGCAACAGACACTCTCCGCGGAGGCTGCCGCCGTGCTGAAGCACTCCCTCAGCCTGGCCCGGCGCCGCGGCCACGCCCAGGTCACCCCGCTTCATGTCGCCGCCACACTCCTGACGTCCCGCTCCAGCCTCCTCCGCCGCGCCTGCCTCAAGTCCCAGCCCCCCCACCACCCCTTGCAATGCCGCGCCCTGGAGCTGTGCTTCAACGTGGCCCTCAACCGCCTCCCGGCCTCCCCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806430.1
MRAGGCAAQQTLSAEAAAVLKHSLSLARRRGHAQVTPLHVAATLLTSRSSLLRRACLKSQPPHHPLQCRALELCFNVALNRLPASPGPLLHAQPSLSNALVAALKRAQAHQRRGCVEQQQQQPPLLALKVELEQLILSILDDPSVSRVMREAGFSSTAVKANLDDCTASVFHCYNPSASASGGIYSTPNSPPSARPLPDFLSHHDITRLLHIMTSARPRRNVVVVADTSSMAETLVAQLISLVEKGDVPDQLKAARLVKF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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