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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002163`

染色体: Chr04 坐标: 34884187-34886071 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002163`
名称	SmilChr04G002163
描述	scarecrow-like protein 32
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	34884187 - 34886071 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021316`
GeneID	`131021316`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021316`
原始查询	`SmilChr04G002163`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	scarecrow-like protein 32
产物	scarecrow-like protein 32
Arabidopsis	`AT3G49950` (AT3G49950) GRAS family transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824157] identity=49.4; qcov=0.92; evalue=2e-126; confidence=high
Rice	`Os05g0500600` - identity=52.6; qcov=0.92; evalue=1.02e-131; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03514 (GRAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021316

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806431.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057806431.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057806431.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806431.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806431.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:34884483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C79,D10
`Chr4:34884496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B30,B35,B55,C23
`Chr4:34884511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C59,C84
`Chr4:34884568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B69,D7
`Chr4:34884601`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:34884615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:34884662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C59,C84
`Chr4:34884691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:34884888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr4:34884955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:34885023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C39,C75,D7
`Chr4:34885123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806431.1

440 aa

220

440

GRAS

PF03514 GRAS 47-429 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806431.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	47	429	1.9e-87	294.4	GRAS domain family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950448.1
CCCGTAGCTCCTTAATTAAGTTAGAGGATTCATGCACTCAATATTTTTGGATTGTTATTAGTTTTTAGTCATTGGTAGAGATATTCCTTTTCTTGTATCTATATATAAAACCCTAGTTCGTAGTGAAAGATAAAAATTGGTTTCCTTCTTCTCCCGTTTCTCTCTCTCTCTCGTTAATGTTTTAGATCACCCACTAAATCTCAAGTACATACAAGAAAAAAGAAAAGAAAAAAGAAACCCTAATTCTTCCACAAACACGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021316
ATGAAAGCAGAAGCAAGAGGCATGAATCCACCAACCATTTCTCCCCTGCAAAACCCTAGCGGCCTCTTCACCAACTCCCGCGGCTCCATCTCCGGCGCCTTGACGGGATGCCTGAGCAGCCTCGACGGCGCGTGCATTGAGAAGCTCCTCCTCCACTGCGGCAGCGCCCTCGAGAGCAACGACGTCACCCTCGCTCAGCAAGTGATGTGGGTTCTCAACAACGTCGCCTCGTCCACAGGCGACCCCAACCAGCGCCTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806431.1
MKAEARGMNPPTISPLQNPSGLFTNSRGSISGALTGCLSSLDGACIEKLLLHCGSALESNDVTLAQQVMWVLNNVASSTGDPNQRLASYFLRALISRASRVCPTTMSFKPAAPHRRLMSVTELAGYVDLLPWHRFGFCAANSAILEAVRGFPSVHILDLSITHCMQWPTFIDALGKVPGGPPAALRISVPSWRPPAPPLLNASIEEVGQRLVNFAKFRDVPFEFNVVDLGGEEEEEESAYDSLLSQLNAFAVKVNADEAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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