当前解析结果
SmilChr04G002164| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002164 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002164 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G002164 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 34912024 - 34912943 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023353 |
|---|---|
| GeneID | 131023353 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023353 |
| 原始查询 | SmilChr04G002164 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023353 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808877.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057808877.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.80000 | XP_057808877.1 |
| 4 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057808877.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808877.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:34912038 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A13,B3,C13 |
Chr4:34912088 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A23,D4 |
Chr4:34912091 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 5 | B21,B30,B76,B95,C25 |
Chr4:34912091 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | B21,B30,B76,B95,C25 |
Chr4:34912216 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B38,B39 |
Chr4:34912229 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B38,B39 |
Chr4:34912233 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B38,B39 |
Chr4:34912276 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B38 |
Chr4:34912285 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B38 |
Chr4:34912340 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B28,B71,B93,C33,C62 |
Chr4:34912375 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C53,C68 |
Chr4:34912380 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C53,C68 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。