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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002167`

染色体: Chr04 坐标: 34950420-34955821 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002167`
名称	SmilChr04G002167
描述	protein CHLOROPLAST IMPORT APPARATUS 2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	34950420 - 34955821 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021318`
GeneID	`131021318`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021318`
原始查询	`SmilChr04G002167`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein CHLOROPLAST IMPORT APPARATUS 2-like
产物	protein CHLOROPLAST IMPORT APPARATUS 2-like
Arabidopsis	`AT5G57180` (CIA2) chloroplast import apparatus 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835824] identity=39.7; qcov=1.17; evalue=4.31e-67; confidence=medium
Rice	`Os03g0711100` (OsCOL10) - identity=43.7; qcov=0.319; evalue=3.62e-17; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF06203 (CCT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021318

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806434.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057806434.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806434.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806434.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806434.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:34951307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:34954192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,D4
`Chr4:34954234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:34954316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B76,C49
`Chr4:34954371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C48
`Chr4:34954397`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:34954486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr4:34954504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,C71
`Chr4:34954509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr4:34954511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,C71
`Chr4:34954588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B53,C62
`Chr4:34954589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,C56,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806434.1

377 aa

188

377

CCT

PF06203 CCT 324-360 aa

XP_057806435.1

373 aa

186

373

CCT

PF06203 CCT 324-365 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806434.1`	Pfam	`PF06203`	CCT	Motif	324	360	4.4e-13	49.7	CCT motif
`XP_057806435.1`	Pfam	`PF06203`	CCT	Motif	324	365	6.6e-18	65.2	CCT motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950451.1
AAAGATAATTCAAATTATATTTATAAATTCGAGTTAAAAAGCTACTATATAGTAAAAGTAAACTAGTAAGTTCACAAAAATATGGTAGTGCTGAAAAGTGCACAAGACAGGTAGAAAGAGAAGAAAGTGGTCCACCTATATACAATTGCAGGAGCCAAACGCTGCGTTGTCCCTTCCTCTGTTCTCATCTCTCTCCCTCCATCCATTTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGTGTTTGTTTTCTGAAATGCACAGCACA...

XM_057950452.1
GAAAGAGAAGAAAGTGGTCCACCTATATACAATTGCAGGAGCCAAACGCTGCGTTGTCCCTTCCTCTGTTCTCATCTCTCTCCCTCCATCCATTTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGTGTTTGTTTTCTGAAATGCACAGCACAGGTATATATCTCCAGCTGATCCTAAAACCTCTGTCTGCCCGTGACCCTCTCCGTACCCATCATTCTCTCTCTCCTTAGATATTTCATATTTGTCCCAATAAAATAAAGGTAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131021318
ATGTCTTCATGTTTAAGTGGAAGAGCATACAGATTGAATCTGGACTTGATAAAACCCCCAACTACCACTTTTTCCACATCAAATTCATCATCTCCCTCTTCAACTCTCTCGGAATCAAGCAACTCCCCCCTCTCAATCTTCACCAGAAAACCCCGCACGCCGCGGAAACGGCCTAATCAGACCTACAACGAGGCGGCGGCGATTCTCTTCACCGCCTACCCCAAGCTATTCCCGCCCAAAAACCTCCCAAAACCCTTCAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057806434.1
MSSCLSGRAYRLNLDLIKPPTTTFSTSNSSSPSSTLSESSNSPLSIFTRKPRTPRKRPNQTYNEAAAILFTAYPKLFPPKNLPKPFKLTKSHDNRGPFLSEPPDLLIPFHHRDKGCLLQRPPLPTAEKPCRSPGEVTSSRGDLLEICDEFEEDFDAESILDEEVEEGIDSIMGNPRAEGAAAEFRDSGVVGGGFCYGFPVGMGFDFGCGMMMKAMRNADGGDQWSSPRVNVVDIIAGAPAVKKAAKKKKKKLEDLSNSRE...

XP_057806435.1
MSSCLSGRAYRLNLDLIKPPTTTFSTSNSSSPSSTLSESSNSPLSIFTRKPRTPRKRPNQTYNEAAAILFTAYPKLFPPKNLPKPFKLTKSHDNRGPFLSEPPDLLIPFHHRDKGCLLQRPPLPTAEKPCRSPGEVTSSRGDLLEICDEFEEDFDAESILDEEVEEGIDSIMGNPRAEGAAAEFRDSGVVGGGFCYGFPVGMGFDFGCGMMMKAMRNADGGDQWSSPRVNVVDIIAGAPAVKKAAKKKKKKLEDLSNSRE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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