当前解析结果
SmilChr04G002170| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002170 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002170 |
| 描述 | acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32-related protein 2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 35050729 - 35051337 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023355 |
|---|---|
| GeneID | 131023355 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023355 |
| 原始查询 | SmilChr04G002170 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32-related protein 2-like |
| 产物 | acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32-related protein 2-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023355 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808879.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057808879.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057808879.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808879.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808879.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:35050764 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B22 |
Chr4:35050783 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B91 |
Chr4:35050783 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B91 |
Chr4:35050793 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A3,B137,B80,C41 |
Chr4:35050805 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B56,B69,B96,D7 |
Chr4:35050815 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B91 |
Chr4:35050917 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C38 |
Chr4:35050921 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C38 |
Chr4:35050944 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A10,B101,B25,C23,D6 |
Chr4:35050987 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 9 | B126,B128,B133,B2,B26,B47,B52,B93,C85 |
Chr4:35051052 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A10,B101,C50,D6 |
Chr4:35051125 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A11,C1,C72,D4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。