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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002174`

染色体: Chr04 坐标: 35134323-35141921 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002174`
名称	SmilChr04G002174
描述	uncharacterized SmilChr04G002174
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	35134323 - 35141921 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021323`
GeneID	`131021323`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021323`
原始查询	`SmilChr04G002174`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0425100; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0425100; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G19260` (AT2G19260) RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816443] identity=45.9; qcov=0.49; evalue=8.93e-62; confidence=medium
Rice	`Os04g0425100` - identity=32.6; qcov=0.849; evalue=5.63e-68; confidence=low
GO	GO:0006338 (chromatin remodeling); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00628 (PHD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021323

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806449.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806449.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806449.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806449.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057806449.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:35136739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr4:35136849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr4:35136940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B69,C9
`Chr4:35137213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr4:35141688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr4:35141697`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806449.1

500 aa

250

500

PHD

PF00628 PHD 253-297 aa

XP_057806450.1

498 aa

249

498

PHD

PF00628 PHD 251-295 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806449.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	253	297	3.2e-10	40.6	PHD-finger
`XP_057806450.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	251	295	3.2e-10	40.6	PHD-finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950467.1
TAAATATATTTGCATAGTGCATAACTACACAACTCTCTTCTCTTCTCCCTCTCTTTTCTCTCTCCCCACCATACCTCTCTCTTGGACAGAAAACCCAGAGCCCAGCGAAAAGCGTTGGAGCAAGAGTTTACTGATGCAACTGTTGCAATGGCAGACTAACGGTACCAAGATTCTGAGAAGATGTTCAGTTTGTTGTGGACGCCATTTTGATGGCTGTGGAGAGCTTTTTACGGAGGAGAGGAAAACTGATGATGTTCTGC...

XM_057950466.1
CACAACTCTCTTCTCTTCTCCCTCTCTTTTCTCTCTCCCCACCATACCTCTCTCTTGGACAGAAAACCCAGAGCCCAGCGAAAAGCGTTGGAGCAAGAGTTTACTGATGCAACTGTTGCAATGGCAGACTAACGTTAAAATGTTGATGGGAATTTCCAATCCTTTTTACATGGAAGTTGTTCTTCCGACTTCATGAAACAAGGGTTTACATGTGACCTGATGCCAGGTACCAAGATTCTGAGAAGATGTTCAGTTTGTTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131021323
ATGCAACTGTTGCAATGGCAGACTAACGGTACCAAGATTCTGAGAAGATGTTCAGTTTGTTGTGGACGCCATTTTGATGGCTGTGGAGAGCTTTTTACGGAGGAGAGGAAAACTGATGATGTTCTGCGCTTCTTAAACTACACAACAGATTGTTCGCTGCTATCAACATCCAGTACAATGTCTCAGAACTCCATGCCCACTTTCGTATACCGACGTAGAAGATACCATAAGAACTCTCTTTCATTCTTCGAAATTGAGTC...

LOC131021323
ATGAAACAAGGGTTTACATGTGACCTGATGCCAGGTACCAAGATTCTGAGAAGATGTTCAGTTTGTTGTGGACGCCATTTTGATGGCTGTGGAGAGCTTTTTACGGAGGAGAGGAAAACTGATGATGTTCTGCGCTTCTTAAACTACACAACAGATTGTTCGCTGCTATCAACATCCAGTACAATGTCTCAGAACTCCATGCCCACTTTCGTATACCGACGTAGAAGATACCATAAGAACTCTCTTTCATTCTTCGAAAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057806449.1
MKQGFTCDLMPGTKILRRCSVCCGRHFDGCGELFTEERKTDDVLRFLNYTTDCSLLSTSSTMSQNSMPTFVYRRRRYHKNSLSFFEIESSAGTKPSDACHSAVCSEAPMLAGKEYLVSVSERATEDVRSPTVHPVENNKVAAASSNGFRAVEEAGSEEALTTDGDRILNDCSANDHCSSSKSNLELSSAALKVNTDDAGECSSSGALIAGKAPEEISERDVCISILRSQGLLDKVWVRRASNENTNNYCSKSCKVCKKTE...

XP_057806450.1
MQLLQWQTNGTKILRRCSVCCGRHFDGCGELFTEERKTDDVLRFLNYTTDCSLLSTSSTMSQNSMPTFVYRRRRYHKNSLSFFEIESSAGTKPSDACHSAVCSEAPMLAGKEYLVSVSERATEDVRSPTVHPVENNKVAAASSNGFRAVEEAGSEEALTTDGDRILNDCSANDHCSSSKSNLELSSAALKVNTDDAGECSSSGALIAGKAPEEISERDVCISILRSQGLLDKVWVRRASNENTNNYCSKSCKVCKKTESS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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