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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002183`

染色体: Chr04 坐标: 35277281-35278794 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002183`
名称	SmilChr04G002183
描述	GCN5-related N-acetyltransferase 6, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	35277281 - 35278794 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021334`
GeneID	`131021334`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021334`
原始查询	`SmilChr04G002183`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GCN5-related N-acetyltransferase 6, chloroplastic-like
产物	GCN5-related N-acetyltransferase 6%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G06025` (AT2G06025) Acyl-CoA N-acyltransferases (NAT) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815157] identity=47.6; qcov=0.706; evalue=9.23e-58; confidence=high
Rice	`Os03g0177000` - identity=41; qcov=0.718; evalue=4.03e-41; confidence=medium
GO	GO:0016747 (acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups)
KEGG	-
Pfam	PF00583 (Acetyltransf_1); PF08445 (FR47); PF13302 (Acetyltransf_3); PF13420 (Acetyltransf_4); PF13508 (Acetyltransf_7); PF13673 (Acetyltransf_10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021334

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057806471.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057806471.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806471.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806471.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806471.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:35277360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B5,B51,C46,C83
`Chr4:35277365`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr4:35277558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B5,B51,C46,C83
`Chr4:35278209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr4:35278328`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr4:35278389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B56,B96,C2
`Chr4:35278396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B137,B80,C41
`Chr4:35278403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B89,C26
`Chr4:35278433`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806471.1

262 aa

131

262

Acetyltransf_1

Acetyltransf_4

Acetyltransf_7

FR47

Acetyltransf_10

Acetyltransf_3

PF00583 Acetyltransf_1 117-239 aa PF13420 Acetyltransf_4 162-242 aa PF13508 Acetyltransf_7 172-240 aa PF08445 FR47 179-242 aa PF13673 Acetyltransf_10 180-249 aa PF13302 Acetyltransf_3 184-240 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806471.1`	Pfam	`PF00583`	Acetyltransf_1	Family	117	239	4.1e-16	60.0	Acetyltransferase (GNAT) family
`XP_057806471.1`	Pfam	`PF13420`	Acetyltransf_4	Domain	162	242	2.4e-05	25.2	Acetyltransferase (GNAT) domain
`XP_057806471.1`	Pfam	`PF13508`	Acetyltransf_7	Domain	172	240	1.2e-09	39.2	Acetyltransferase (GNAT) domain
`XP_057806471.1`	Pfam	`PF08445`	FR47	Family	179	242	8.8e-08	32.8	FR47-like protein
`XP_057806471.1`	Pfam	`PF13673`	Acetyltransf_10	Domain	180	249	5.3e-10	40.1	Acetyltransferase (GNAT) domain
`XP_057806471.1`	Pfam	`PF13302`	Acetyltransf_3	Domain	184	240	1.9e-06	29.3	Acetyltransferase (GNAT) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950488.1
TCGTCAGCACATAAACACAGAACTCTCTCTCTCTCTCTTCTTCAGAAAAAGAAAAGCTACGGATTCATGTCGTCGATTGCTTTACCCATACCATACTTGTCAAGAACCAAGTTGAGTTGCGCATTTCCAAGAAATCTCAACCCTACTAAAAACACGTCAACCTGGGGAAGAATTGCGATGATGAATTCTGCTGGAAAGGGGAAATCTGTTATAAGCGATGAAGAGAATCCGTTGATCACAGCGGTGGCGTGTGATCTTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021334
ATGTCGTCGATTGCTTTACCCATACCATACTTGTCAAGAACCAAGTTGAGTTGCGCATTTCCAAGAAATCTCAACCCTACTAAAAACACGTCAACCTGGGGAAGAATTGCGATGATGAATTCTGCTGGAAAGGGGAAATCTGTTATAAGCGATGAAGAGAATCCGTTGATCACAGCGGTGGCGTGTGATCTTGGGGAATGCGAGCCACGTGAGGCTCAACTTGATGAAGAATATTGGGCGGCAGCATGGCTCAGAGCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806471.1
MSSIALPIPYLSRTKLSCAFPRNLNPTKNTSTWGRIAMMNSAGKGKSVISDEENPLITAVACDLGECEPREAQLDEEYWAAAWLRAEIYWEGPQNERNAEKFKRIFAEREFAALKQRCDVQLGKNCTCILMVKKEEDDTIVNRVVGTLDFHVKFFSPGQTFPDEIIVHQRMGSIDRSASNSYGYILNICVARSARRRGVATTMLQHVISTAKEQSIKKVFLRVYGDNEGAVRLYEKVGFKAVEAPNCANCSAMPLLLMCF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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