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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002188`

染色体: Chr04 坐标: 35379602-35385287 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002188`
名称	SmilChr04G002188
描述	pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH10-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	35379602 - 35385287 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023357`
GeneID	`131023357`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023357`
原始查询	`SmilChr04G002188`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH10-like
产物	pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH10-like
Arabidopsis	`AT1G26370` (AT1G26370) RNA helicase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839179] identity=67.4; qcov=0.977; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0192500` (P0698A06.12-1) - identity=68.4; qcov=0.553; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005622 (intracellular anatomical structure); GO:0005730 (nucleolus); GO:0045943 (positive regulation of transcription by RNA polymerase I)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00271 (Helicase_C); PF04408 (WHD_HA2); PF07717 (OB_NTP_bind); PF21010 (HA2_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023357

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808881.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057808881.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808881.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808881.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808881.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:35380375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr4:35380406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr4:35380424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B79
`Chr4:35380604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:35380613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,D10
`Chr4:35380645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr4:35380665`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B34,C16
`Chr4:35380801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:35380886`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr4:35381314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr4:35383609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C24
`Chr4:35383787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B30,B35,B55,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808881.1

732 aa

366

732

Helicase_C

WHD_HA2

HA2_C

OB_NTP_bind

PF00271 Helicase_C 302-428 aa PF04408 WHD_HA2 489-518 aa PF21010 HA2_C 519-578 aa PF07717 OB_NTP_bind 650-726 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808881.1`	Pfam	`PF00271`	Helicase_C	Domain	302	428	7.7e-11	42.9	Helicase conserved C-terminal domain
`XP_057808881.1`	Pfam	`PF04408`	WHD_HA2	Domain	489	518	3.2e-06	27.8	Helicase associated domain (HA2), winged-helix
`XP_057808881.1`	Pfam	`PF21010`	HA2_C	Domain	519	578	3.2e-11	44.3	Helicase associated domain (HA2), ratchet-like
`XP_057808881.1`	Pfam	`PF07717`	OB_NTP_bind	Domain	650	726	2.4e-21	76.4	Oligonucleotide/oligosaccharide-binding (OB)-fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952898.1
ATGGCCTCCAACAAAGCTAATCACACTGCCAAAATCAATCATCTCAATGCTGCCCCTAAAGCTGACTTCATCGCCAGGAGGCAAAAAATCGAGAAGCACAGGAAAGCTCTGCCGATTGCTTCGGGAGTGCAAAATTTATGTCAAAGAAACGATTGTGCTTCTAATTTTTGGTATTGTGCAGTCGAAAAGAGACTAGTGGAAGAGGTTCGCAACAACGACGTACTAATTATTGTTGGGGAAACTGGCAGTGGGAAGACAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023357
ATGGCCTCCAACAAAGCTAATCACACTGCCAAAATCAATCATCTCAATGCTGCCCCTAAAGCTGACTTCATCGCCAGGAGGCAAAAAATCGAGAAGCACAGGAAAGCTCTGCCGATTGCTTCGGGAGTGCAAAATTTATGTCAAAGAAACGATTGTGCTTCTAATTTTTGGTATTGTGCAGTCGAAAAGAGACTAGTGGAAGAGGTTCGCAACAACGACGTACTAATTATTGTTGGGGAAACTGGCAGTGGGAAGACAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808881.1
MASNKANHTAKINHLNAAPKADFIARRQKIEKHRKALPIASGVQNLCQRNDCASNFWYCAVEKRLVEEVRNNDVLIIVGETGSGKTTQLPQYLFDGGFCRNGRVIGITQPRRVAAVTVAKRVAEESGVTLGQKVGYSIRFDDVTSASTRIKYMTDGLLLREALLDPYLSKYSVIIVDEAHERTVHTDVLLGLLKAVQKTRSQGINDTVHKQLIKAENGIQLEKENEIESTSILKHNQGKKLSPLKLVIMSASLDAKIFSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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