当前解析结果
SmilChr04G002190| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002190 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002190 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G002190 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 35398187 - 35398858 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023358 |
|---|---|
| GeneID | 131023358 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023358 |
| 原始查询 | SmilChr04G002190 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023358 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808882.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808882.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808882.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057808882.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057808882.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:35398229 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 35 | A10,A13,A24,B100,B101,B11,B118,B23,B53,B56,B58,B63,B65,B66,B8,B85,B86,B90,B92,B94,B96,C30,C31,C36,C38,C50,C56,C6,C73,C79,C8,C86,D11,D6,D8 |
Chr4:35398290 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B140 |
Chr4:35398290 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr4:35398320 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 18 | B101,B113,B115,B128,B135,B26,B68,B75,B87,C15,C39,C40,C42,C61,C74,C85,C9,D2 |
Chr4:35398336 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B26,C11,C69 |
Chr4:35398341 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B88 |
Chr4:35398341 |
AG |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B88 |
Chr4:35398383 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B24,B59,B86,C77 |
Chr4:35398389 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B138 |
Chr4:35398421 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B33,C14 |
Chr4:35398426 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr4:35398488 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A23,A8,B103,C63,C87 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。