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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002192`

染色体: Chr04 坐标: 35458984-35459621 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002192`
名称	SmilChr04G002192
描述	cytochrome c biogenesis CcmF C-terminal-like mitochondrial protein
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	35458984 - 35459621 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023360`
GeneID	`131023360`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023360`
原始查询	`SmilChr04G002192`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome c biogenesis CcmF C-terminal-like mitochondrial protein
产物	cytochrome c biogenesis CcmF C-terminal-like mitochondrial protein
Arabidopsis	`ATMG00180` (ccmFC) - identity=84.3; qcov=0.914; evalue=5.05e-86; confidence=high
Rice	`gene-ccmFc` - identity=81.4; qcov=0.9; evalue=4.55e-100; confidence=high
GO	GO:0017004 (cytochrome complex assembly)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023360

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808883.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057808883.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808883.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808883.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808883.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:35459013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B41
`Chr4:35459017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,C21,C29,D4
`Chr4:35459057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C2
`Chr4:35459063`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A10,B37,C50,D6
`Chr4:35459063`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A10,B37,C50,D6
`Chr4:35459138`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:35459213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C63
`Chr4:35459268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,C49,C63
`Chr4:35459299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr4:35459362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr4:35459379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr4:35459381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,A8,B107

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

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cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952900.1
TTACTTCCATGGTCGTGCCTCGTGGCACGGCAGCACCCGTACTATTGAAATGGTTCGTCAGTAGAGATGTTCCCACAGGTGCCCCTTTTTCCAATGGTACTATAATTCCTATTCCTATCCCTTCATTCCCTCTTTTGGTCTATCTACATTCAAGGAAATTCATACGCTCCACAGACAGAGCAAAAAGTAGAGTCTTGGTCACAGCAAGCCGTCCTATTCTATTACCAGACATAATTGGGAGAAGCTCATCCGAAACTAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023360
ATGGTCGTGCCTCGTGGCACGGCAGCACCCGTACTATTGAAATGGTTCGTCAGTAGAGATGTTCCCACAGGTGCCCCTTTTTCCAATGGTACTATAATTCCTATTCCTATCCCTTCATTCCCTCTTTTGGTCTATCTACATTCAAGGAAATTCATACGCTCCACAGACAGAGCAAAAAGTAGAGTCTTGGTCACAGCAAGCCGTCCTATTCTATTACCAGACATAATTGGGAGAAGCTCATCCGAAACTAGAGCTAGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808883.1
MVVPRGTAAPVLLKWFVSRDVPTGAPFSNGTIIPIPIPSFPLLVYLHSRKFIRSTDRAKSRVLVTASRPILLPDIIGRSSSETRARNALFRFVPVLHFLLLESKGDNSYLESFCGVLGLLFFRTFFFLPRDRSAKRERARRRKGQTLRPNGNKQGRNEKMRCPGHPQRRVEAFRPVAFPVPPSSCGVNNKQDYKKSKNSIHILQFEPYS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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