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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002198`

染色体: Chr04 坐标: 35597271-35598190 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002198`
名称	SmilChr04G002198
描述	protein SMALL AUXIN UP-REGULATED RNA 51-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	35597271 - 35598190 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021347`
GeneID	`131021347`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021347`
原始查询	`SmilChr04G002198`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SMALL AUXIN UP-REGULATED RNA 51-like
产物	protein SMALL AUXIN UP-REGULATED RNA 51-like
Arabidopsis	`AT3G43120` (AT3G43120) SAUR-like auxin-responsive protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823371] identity=34.6; qcov=0.824; evalue=2.96e-22; confidence=low
Rice	`Os02g0143400` (OsSAUR5) - identity=39.2; qcov=0.758; evalue=1.03e-21; confidence=medium
GO	GO:0009733 (response to auxin)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02519 (Auxin_inducible)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021347

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057806493.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057806493.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057806493.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806493.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806493.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:35597570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B26
`Chr4:35597572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr4:35597623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr4:35597642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,D6
`Chr4:35597676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,D6
`Chr4:35597825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B41
`Chr4:35597826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr4:35598008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806493.1

165 aa

165

Auxin_inducible

PF02519 Auxin_inducible 16-122 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806493.1`	Pfam	`PF02519`	Auxin_inducible	Domain	16	122	9.1e-26	90.6	Auxin responsive protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950510.1
GCGAGGGCTGATTTGGTAAAACCAAAATACGAGTGCAATTTAGTCATTCGAAGGCTGGCCACACTCTCCTTCTTAACACTCTCTCACTTTCACTTTCACTTTCTGCTCTCTGAAGAACTCTCCCTCTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCTCTCAAATGTCGTCAGGCATGAAGAAAGTGAACATGATCAGCAAAATCGTCCGGCTGAAACAAGTCGTCACCCGCTGGAAATCCAAGAGCGTGAGGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021347
ATGTCGTCAGGCATGAAGAAAGTGAACATGATCAGCAAAATCGTCCGGCTGAAACAAGTCGTCACCCGCTGGAAATCCAAGAGCGTGAGGGGCGGCGGCAACAATCTCTTCTACTCCTCCTCGGACTCCGACTACGACGAACCGGCCGGTCCGAACCGCCGCACCCCCTCGGGCTCCGTGGCGGTCTACGTCGGCCCGGAACGCCGCCGCTTCGTCATCCCGACCCGGTTTCTCAACCTTCCGGTCTTCGTCGCCCTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806493.1
MSSGMKKVNMISKIVRLKQVVTRWKSKSVRGGGNNLFYSSSDSDYDEPAGPNRRTPSGSVAVYVGPERRRFVIPTRFLNLPVFVALLNQAEEEFGYPPTGGLTLPCETVFFTNILRLLEKDEERFRGLGIDEFLQASFDSYDRSSCKGPSPPGRAVTPLLQKTRV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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