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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002199`

染色体: Chr04 坐标: 35607346-35610055 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002199`
名称	SmilChr04G002199
描述	uncharacterized SmilChr04G002199
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	35607346 - 35610055 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023364`
GeneID	`131023364`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023364`
原始查询	`SmilChr04G002199`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000]; symbol=AT1G31150; hit=AT1G31150; species=arabidopsis; confidence=low
产物	K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000]; symbol=AT1G31150; hit=AT1G31150; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G31150` (AT1G31150) K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000] identity=25.4; qcov=0.43; evalue=1.49e-08; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09331 (DUF1985); PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023364

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808886.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057808886.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808886.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808886.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808886.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:35607696`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	37	A11,A20,A22,A5,B1,B101,B110,B112,B120,B13,B17,B19,B20,B23,B25,B28,B29,B43,B51,B52,B57,B58,B62,B66,B92,B93,B94,C10,C18,C2,C31,C36,C6,C67,C70,C79,D9
`Chr4:35607700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B87,C57,C78,D9
`Chr4:35607701`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C4
`Chr4:35607701`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C4
`Chr4:35607748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C49,C79
`Chr4:35607749`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C48,D11
`Chr4:35607751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C81
`Chr4:35607761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C49,C79
`Chr4:35607766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr4:35607772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C49,C79
`Chr4:35607776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,C3
`Chr4:35607777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808886.1

568 aa

284

568

DUF8566

DUF1985

PF29561 DUF8566 137-285 aa PF09331 DUF1985 140-259 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808886.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	137	285	2.4e-08	34.8	Domain of unknown function (DUF8566)
`XP_057808886.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	140	259	2.4e-11	44.5	Domain of unknown function (DUF1985)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952903.1
GTAAAAAACCCTAAGTAAAAAAAGGATTGAAATTGAATTCAATCGTCTCTCTCCCTTCGCGGTTTCTCTCTCGCGCTTTCCTCTTCTTCTCGTTTTCTCCCAGAAATCGACGGACATCCTCTCCATCCTCTCCATCGTCTCCACTATTATCTCGTTCCCTCGCTCTCCTTGGGTGTATTTCACAGCGTCGCTCCTTGACCAGACGAGTGCGCCGCGACCTTAACCAGCGTGCGACCTCCAGTTGCTGCTCTCCGGCGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023364
ATGGTTGAGCAAGAGAGAGAGAGTTCTCCCGCGACATCTGCTCCATCGGAGCACACCACCACCGCCGTTGAAGGACCGTCCACGGCGGCCGCGGCGACATCTGCTCCACCGGAGCAACAAGTAGAAGAAGAAACGGCCAGAGCAACAATTAGAGAAGAACCTCGATTTAGATGGGTTCGACCCAATATGAGGGGATACCAAGCGCGCGTAAATCTTTATGTGCGTGTGGAGGTCATGAATCGGGTTCGACAGAAACTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808886.1
MVEQERESSPATSAPSEHTTTAVEGPSTAAAATSAPPEQQVEEETARATIREEPRFRWVRPNMRGYQARVNLYVRVEVMNRVRQKLHGIGSSELEQRFLDGVFGHLVQLRRSGSANNALSELIARELHDASFSEFEKRYFVGGHEVSFTAQDYALVTGLRFGPSDFDPTADHVIPQSSLYMRHFDGKRVRINTLEQKFNDGLFRDPEDLLKVAHILILYHILICRGESIWIDEWVWALVEDSEAWARFPWGSYNFSILCH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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