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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002202`

染色体: Chr04 坐标: 35642919-35648232 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002202`
名称	SmilChr04G002202
描述	probable cation transporter HKT1;4
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	35642919 - 35648232 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021350`
GeneID	`131021350`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021350`
原始查询	`SmilChr04G002202`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable cation transporter HKT1;4
产物	probable cation transporter HKT1%3B4
Arabidopsis	`AT4G10310` (HKT1) high-affinity K+ transporter 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826623] identity=47.2; qcov=0.925; evalue=1.39e-141; confidence=high
Rice	`Os02g0175000` (HKT1;3) probable cation transporter HKT6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4328468] identity=46.5; qcov=0.949; evalue=1.54e-142; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006812 (monoatomic cation transport); GO:0008324 (monoatomic cation transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF02386 (TrkH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021350

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057806494.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057806494.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057806494.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806494.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806494.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:35645822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B76,C49
`Chr4:35646985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr4:35647092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr4:35647121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B44,C50,C59,C84
`Chr4:35647231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr4:35647258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr4:35647384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr4:35647405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C56
`Chr4:35647420`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,D6
`Chr4:35647548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:35647598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B37,B85,C50,D6
`Chr4:35647618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806494.1

534 aa

267

534

TrkH

PF02386 TrkH 175-521 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806494.1`	Pfam	`PF02386`	TrkH	Family	175	521	2.1e-27	96.5	Cation transport protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950511.1
GTTCACAGTTATTTAAAAACAAAGTCATATTGTCATGTCATTCTGCAGTTGCGGATATTGTCCCTCCCCTAACTTGAGAATTTGGCCACAACGTAAAAAGTTGATGCCTAGATGCATCAATTTTCTTGTGACGAAAACGCTATATATAGTTATAGCCCCATTGCGTCTATGCATATTTATCAGCATAATCCCACAAAACTGTGCTGTGTGTGAAAGTCAGGGATGGACTTTTCTTGTTACAGAAAGAAATATTTTGGTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021350
ATGGACTTTTCTTGTTACAGAAAGAAATATTTTGGTAGTAATTTTTGGAAAATGACTAAGTTGTTCATCTCTTGTTGCTACCGCGACCTTCTCTTCAATACCAACGCATTATTCACATATATTCTCTACTTTGTCTGTCTCTCCTGCGTTGGTTTCGGAATCCTCAAGGCCTTGAAGCCCAGAACCAACCAGTTGGCGCCTCGAAACATCGACTTGTTCTACACTTCTGTTTCAGCCGCCACTGTGTCGAGCATGTCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806494.1
MDFSCYRKKYFGSNFWKMTKLFISCCYRDLLFNTNALFTYILYFVCLSCVGFGILKALKPRTNQLAPRNIDLFYTSVSAATVSSMSAVEMEVFSNSQLMSMTFLMFAGGEIFVSMLILRLNALKMARTSRVEGKTEPPVSDSPSTTRYQTSSGFDQIELNVVKVRDEMGSSPSHQSLNDESVLKHDSIKFLSFVALGYLLVVQVFGIASVLIYLTLVTGAENVLRNKGIKTFTFALFTVVSTFSSCGFVPTNENMIVFRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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