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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002207`

染色体: Chr04 坐标: 35745743-35747862 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002207`
名称	SmilChr04G002207
描述	uncharacterized SmilChr04G002207
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	35745743 - 35747862 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021357`
GeneID	`131021357`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021357`
原始查询	`SmilChr04G002207`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834358]; symbol=AT5G43400; hit=AT5G43400; species=arabidopsis; confidence=high
产物	plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834358]; symbol=AT5G43400; hit=AT5G43400; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G43400` (AT5G43400) plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834358] identity=56.9; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0179600` - identity=53.1; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF11443 (DUF2828); PF25043 (DUF7788)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021357

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057806500.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057806500.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057806500.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806500.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806500.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:35745824`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C56
`Chr4:35745824`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C56
`Chr4:35745936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B124
`Chr4:35745961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr4:35746124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B76,C23,C49
`Chr4:35746209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:35746663`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B71
`Chr4:35746663`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B71
`Chr4:35746764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr4:35746838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr4:35747083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr4:35747146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,B76,C58,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806500.1

638 aa

319

638

DUF2828

DUF7788

PF11443 DUF2828 38-436 aa PF25043 DUF7788 438-624 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806500.1`	Pfam	`PF11443`	DUF2828	Repeat	38	436	1.9e-136	455.8	Domain of unknown function (DUF2828)
`XP_057806500.1`	Pfam	`PF25043`	DUF7788	Domain	438	624	2.5e-80	269.6	Domain of unknown function (DUF7788)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950517.1
AAATTAAATGAGGTGCGTAGCATCCAAGTTTGCGCCGCTACAAAAGAAAGCTTGATTCACTCATTAATTTCAGTAACATATTCGCAATCACCTCTTTCCATCACAAACACGACCAATCTCCTCTCTAACAATCATGGCTGCTCTTCTCGTCGGGCCACCTGAGATCTACCCACAATCCTCCATACATGTATGCGTCTTAAATTTCAAGAAAGCTCTAATCGGTGAAAGCCCTCCAATGGGCCTCACCGAAAATCTTTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021357
ATGGCTGCTCTTCTCGTCGGGCCACCTGAGATCTACCCACAATCCTCCATACATGTATGCGTCTTAAATTTCAAGAAAGCTCTAATCGGTGAAAGCCCTCCAATGGGCCTCACCGAAAATCTTTCTCCGACATTTCTATCGACGGGCAATCCCTGTCTGGATTTCTTCTTCCACGTCGTCCCCGACACGCCACCGGAAACCTTGATCAACCGCCTGCGGCTCGCGTGGGCTCACGACCCATTGAAGGCCCTGAAGCTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806500.1
MAALLVGPPEIYPQSSIHVCVLNFKKALIGESPPMGLTENLSPTFLSTGNPCLDFFFHVVPDTPPETLINRLRLAWAHDPLKALKLVCNLRGVRGTGKSDKEGFYTAALWLHDCHPKTLAANVAAFTDFGYMKDLLEILFRILEGPKARESAKETGEKWKAWKSAKEQWGRVNKELTEAKKFKKEMKRRRNFCTRTTHLLRMRRCLKTQLTEGRKCVETGQTREEKRLKKAKRVVKRYNEDPKFKLLHDRISDLFAQGLR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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