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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002217`

染色体: Chr04 坐标: 35852532-35854859 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002217`
名称	SmilChr04G002217
描述	uncharacterized SmilChr04G002217
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	35852532 - 35854859 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021366`
GeneID	`131021366`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021366`
原始查询	`SmilChr04G002217`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Uncharacterized conserved protein UCP015417, vWA [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831161]; symbol=AT5G13210; hit=AT5G13210; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Uncharacterized conserved protein UCP015417, vWA [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831161]; symbol=AT5G13210; hit=AT5G13210; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G13210` (AT5G13210) Uncharacterized conserved protein UCP015417, vWA [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831161] identity=58.2; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0652100` - identity=53.2; qcov=0.978; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF11443 (DUF2828); PF25043 (DUF7788)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021366

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057806516.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057806516.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806516.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806516.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806516.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:35852747`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B120
`Chr4:35852747`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B120
`Chr4:35852764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B42,B43,C31
`Chr4:35852766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B124,C21,C29,D4
`Chr4:35852873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C29
`Chr4:35852888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B124,C21,C29,D4
`Chr4:35852917`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,D4
`Chr4:35853235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr4:35853491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B69
`Chr4:35853498`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	47	A1,A16,A19,A5,A9,B104,B119,B12,B121,B123,B126,B127,B131,B132,B139,B2,B20,B25,B27,B31,B53,B59,B61,B67,B78,B87,B95,C14,C19,C2,C24,C27,C35,C39,C41,C45,C50,C53,C55,C58,C60,C74,C79,C86,D11,D4,D9
`Chr4:35853500`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	48	A1,A16,A19,A5,A9,B104,B119,B12,B121,B123,B126,B127,B131,B132,B139,B2,B20,B25,B27,B31,B53,B59,B61,B67,B78,B87,B95,C14,C19,C2,C24,C27,C35,C39,C41,C45,C50,C53,C55,C58,C6,C60,C74,C79,C86,D11,D4,D9
`Chr4:35853528`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B10,B12,B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806516.1

648 aa

324

648

DUF2828

DUF7788

PF11443 DUF2828 64-446 aa PF25043 DUF7788 448-628 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806516.1`	Pfam	`PF11443`	DUF2828	Repeat	64	446	1.5e-134	449.6	Domain of unknown function (DUF2828)
`XP_057806516.1`	Pfam	`PF25043`	DUF7788	Domain	448	628	1.4e-80	270.5	Domain of unknown function (DUF7788)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950533.1
CATTTTCCCCAATCCAGCGCCGCTACAGCTTCTTCTTCATCCGCTTTCTTTTCTTTTCTTTTTGCGTCAAGGAGTGCAGCAACAGCAGAGAGAATAAGAAAGATGTTGTCGTGCTTTCGGGAAGGGCAAGAAGACGCGTTTCGATTGAATTGAGGCGGTAGAATTTTAGGTGATTGAGCTATAGTTCTTTTTTTGTCTTTACATTTGTGGATCATAAATAACTTGCTATACAATCTTGCCGCTTTCATACAATGTCAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021366
ATGTCAATGATCAAATACATTCTCAAAAGCCCTTGTACAAAACCCTTCACCACTCTTCTCGTTGGACCACCGGAAATCTATCAAGAACCACCCAAATCCACTGTCGCCTCCGATGCTGCCACGGGCGATGCTTTCGTCGACATTATGGTCTCAGAATTCAACAAAACAGAAATCGATCTGAGGGGCCTCACGGAGAACCGTTCTCCGACGTTTCTATCGACGGCAAATCCGTGTTTGGATTTCTTCTTCCACATCGTCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806516.1
MSMIKYILKSPCTKPFTTLLVGPPEIYQEPPKSTVASDAATGDAFVDIMVSEFNKTEIDLRGLTENRSPTFLSTANPCLDFFFHIVPDTPPQSLTHRLKLAWDQDPLKALKLVCNLRGVKGTGKSDREGFYTAALWLHDRHPKTLAGNVAAFADFGYHKDFLEILFRILQGPNARASAKEIGEKWKAWKSAKDAWEEMKLLGDCDTDSHLLFMRQSVKAKLMWARKGLQPGKITREEKRLKMARTVVNRYNEDPHFNFLH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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