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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002229`

染色体: Chr04 坐标: 36009714-36011847 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002229`
名称	SmilChr04G002229
描述	uncharacterized SmilChr04G002229
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	36009714 - 36011847 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021375`
GeneID	`131021375`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021375`
原始查询	`SmilChr04G002229`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Uncharacterized conserved protein UCP015417, vWA [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831161]; symbol=AT5G13210; hit=AT5G13210; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Uncharacterized conserved protein UCP015417, vWA [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831161]; symbol=AT5G13210; hit=AT5G13210; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G13210` (AT5G13210) Uncharacterized conserved protein UCP015417, vWA [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831161] identity=60; qcov=0.979; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0652100` - identity=55.3; qcov=0.917; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF11443 (DUF2828); PF25043 (DUF7788)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021375

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057806519.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057806519.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806519.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806519.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806519.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:36009836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr4:36009906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:36009926`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr4:36010277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr4:36010280`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr4:36010439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C29
`Chr4:36010451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B26,C11,C69
`Chr4:36010927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C4,C67
`Chr4:36011014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr4:36011154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C61
`Chr4:36011172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B37,B41,B53,B99,C47
`Chr4:36011228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806519.1

666 aa

333

666

DUF2828

DUF7788

PF11443 DUF2828 91-464 aa PF25043 DUF7788 466-646 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806519.1`	Pfam	`PF11443`	DUF2828	Repeat	91	464	1.1e-135	453.3	Domain of unknown function (DUF2828)
`XP_057806519.1`	Pfam	`PF25043`	DUF7788	Domain	466	646	1.3e-80	270.6	Domain of unknown function (DUF7788)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950536.1
GAAATGTCAAAAACCCTTCTACAATGCTACACATCTGCAGAGACAGATAACTTCTAAAACCCCCTCCCTTCTCACAATCATGGCTGCCGCTCTTCTCGTCGGACCACCGGAAATCTACCAAAAACCACCCAAATCCACCCCCACAGCCTTCGACGTAGCCACGGCAGCCGACATCACCGCCTCCGCCGACGTCGCCATGGCAGCTGACATCACCGCCTCCTCCGACGTCGCCATGGCAGCTGACATTACCGCCTCCGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021375
ATGGCTGCCGCTCTTCTCGTCGGACCACCGGAAATCTACCAAAAACCACCCAAATCCACCCCCACAGCCTTCGACGTAGCCACGGCAGCCGACATCACCGCCTCCGCCGACGTCGCCATGGCAGCTGACATCACCGCCTCCTCCGACGTCGCCATGGCAGCTGACATTACCGCCTCCGCCGACGTCTCCGGCACGGGCAATGCATTCGTCGACCTTATGGTCGCAGAATTTAACAAAACAGCAACCTACGTACCCCCTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806519.1
MAAALLVGPPEIYQKPPKSTPTAFDVATAADITASADVAMAADITASSDVAMAADITASADVSGTGNAFVDLMVAEFNKTATYVPPLRGLTENRSPTFLSTGNPCLDFFFHIVPDTPPESLTNRLKLAWDQDPLKALKLVCNLRGVKGTGKSDKEGFYTAALWLHEHHPKTLAGNAAAFADFGYYKDLLEILFRVLEGAEARKLAKEMGELWKSRTHKGKSGIHKGRKRGVRFPRGLRSSTDTAPLHGAKKSTPEEKRIE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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