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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002230`

染色体: Chr04 坐标: 36018300-36020450 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002230`
名称	SmilChr04G002230
描述	uncharacterized SmilChr04G002230
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	36018300 - 36020450 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021376`
GeneID	`131021376`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021376`
原始查询	`SmilChr04G002230`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834358]; symbol=AT5G43400; hit=AT5G43400; species=arabidopsis; confidence=high
产物	plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834358]; symbol=AT5G43400; hit=AT5G43400; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G43400` (AT5G43400) plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834358] identity=57.2; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0179600` - identity=53.1; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF11443 (DUF2828); PF25043 (DUF7788)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021376

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057806520.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057806520.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057806520.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806520.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806520.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:36018553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr4:36018654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B124
`Chr4:36018828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr4:36018844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr4:36019029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr4:36019272`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	11	A4,B10,B121,B29,B53,B71,B78,C12,C46,C75,C84
`Chr4:36019274`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	A4,B10,B121,B29,B53,B71,B78,C12,C46,C75,C84
`Chr4:36019330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr4:36019353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr4:36019388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B25
`Chr4:36019433`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	142	A1,A11,A14,A15,A20,A21,A4,A5,A8,A9,B10,B101,B102,B103,B104,B105,B109,B11,B111,B112,B118,B12,B121,B123,B124,B127,B129,B130,B132,B134,B136,B16,B19,B2,B20,B22,B25,B26,B29,B3,B31,B34,B37,B38,B4,B40,B42,B43,B44,B48,B49,B53,B54,B55,B56,B57,B59,B60,B61,B63,B66,B67,B68,B69,B71,B72,B74,B75,B76,B77,B78,B83,B84,B85,B86,B89,B9,B90,B92,B93,B94,B95,B96,B98,C10,C12,C13,C14,C16,C17,C19,C2,C25,C26,C28,C29,C3,C30,C31,C33,C35,C39,C4,C41,C45,C46,C47,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C57,C58,C6,C60,C61,C65,C66,C68,C69,C7,C72,C73,C74,C75,C78,C79,C8,C81,C82,C83,C84,C86,C9,D2,D3,D5,D8,D9
`Chr4:36019455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B124,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806520.1

638 aa

319

638

DUF2828

DUF7788

PF11443 DUF2828 38-436 aa PF25043 DUF7788 438-624 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806520.1`	Pfam	`PF11443`	DUF2828	Repeat	38	436	1.1e-134	450.1	Domain of unknown function (DUF2828)
`XP_057806520.1`	Pfam	`PF25043`	DUF7788	Domain	438	624	5e-80	268.6	Domain of unknown function (DUF7788)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950537.1
TTGCGCCCCTACAAAAGAATGCTTGATTCACTCATTAATTTCAGTAACATATTCGCAATCACCTCTTTCCATCACAAACACGACCAATCTCCTCTCTAACAATCATGGCTGCTCTTCTCGTCGGGCCACCTGAGATCTACCCACAATCCTCCATACATGTATGTGTCTTAAATTTCAAGAAAGCTCTAATCGGTGAAAGCCCTCCAATGGGCCTCACCGAATATCTTTCTCCGACATTTCTATCGACGGGCAATCCCTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021376
ATGGCTGCTCTTCTCGTCGGGCCACCTGAGATCTACCCACAATCCTCCATACATGTATGTGTCTTAAATTTCAAGAAAGCTCTAATCGGTGAAAGCCCTCCAATGGGCCTCACCGAATATCTTTCTCCGACATTTCTATCGACGGGCAATCCCTGTCTGGATTTCTTCTTCCACGTCGTCCCCGACACGCCACCGGAAACCTTGATCAACCGCCTGCGGCTCGCGTGGGCTCACGACCCATTGAAGGCCCTGAAGCTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806520.1
MAALLVGPPEIYPQSSIHVCVLNFKKALIGESPPMGLTEYLSPTFLSTGNPCLDFFFHVVPDTPPETLINRLRLAWAHDPLKALKLVCNLRGVRGTGKSDKEGFYTAALWLHDCHPKTLAANVAAFADFGYMKDLLEILFRILEGPKARESAKETGEKWKAWKSAKEQWGRVNRELTEAKKFKKEMKRRRNFWTRTTHLLRMRRCLKTQLTEGRKCVETGQTREEKRLKKAKRVVKRYNEDAKFKVLHDRISDLFAQGLR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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