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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002250`

染色体: Chr04 坐标: 36442867-36444456 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002250`
名称	SmilChr04G002250
描述	uncharacterized SmilChr04G002250
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	36442867 - 36444456 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023375`
GeneID	`131023375`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023375`
原始查询	`SmilChr04G002250`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023375

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808897.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808897.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057808897.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057808897.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808897.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:36442887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:36442960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B84
`Chr4:36442997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C45,D7
`Chr4:36443091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr4:36443305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C70,C85
`Chr4:36443394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C70,C85
`Chr4:36443422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B29,B72,B80,C31,C80,C87
`Chr4:36443427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C50,C85
`Chr4:36443439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C84,D10
`Chr4:36443442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C48
`Chr4:36443445`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B62,C50,C85
`Chr4:36443482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B138,B4,B62,C19,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808897.1

507 aa

254

507

Asp_protease_2

PF13650 Asp_protease_2 178-268 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808897.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	178	268	3.5e-06	28.3	Aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952914.1
ATGCCAAAGTCAGAGCTTCCGAAATCACCTCTGGCGAAGCCAGTCCTGCCGATTCCAGAGATGCCGAAGGCACCTCTGGCGAAGCCAGCTCTGCCGAGTCCAGAGATGCCGAAGTTACCTCTGGAGAAGTCAGTTCTGCAGAGTTCCACCGCACAAGGTTCAATTCTGCCAAGTTCCACTCTGACGAGCCCTTATGAAGAAAAAGGACCAGAGCAGAAGAAAAAGGAAGGAGAGAAGGAAGATCAGCCAAAAGACGGAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023375
ATGCCAAAGTCAGAGCTTCCGAAATCACCTCTGGCGAAGCCAGTCCTGCCGATTCCAGAGATGCCGAAGGCACCTCTGGCGAAGCCAGCTCTGCCGAGTCCAGAGATGCCGAAGTTACCTCTGGAGAAGTCAGTTCTGCAGAGTTCCACCGCACAAGGTTCAATTCTGCCAAGTTCCACTCTGACGAGCCCTTATGAAGAAAAAGGACCAGAGCAGAAGAAAAAGGAAGGAGAGAAGGAAGATCAGCCAAAAGACGGAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808897.1
MPKSELPKSPLAKPVLPIPEMPKAPLAKPALPSPEMPKLPLEKSVLQSSTAQGSILPSSTLTSPYEEKGPEQKKKEGEKEDQPKDGVMEEGKEAKLHKSTTPYRPPIPFPGRLRNEKMDKQKVPAYVKFFKELVSNKRKFEDNEKVLVSEIANSIIQQPLPPKQRDPGSFVIKIALGNGKEATGMLDLGAGINLMPYSIFKQLELGDLKPTRMCLQLADRSVRYPRGIIEDVLVNVGGLIIPVDFVVLDIGEVHENGVEH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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