当前解析结果
SmilChr04G002270| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002270 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002270 |
| 描述 | protein FAR1-RELATED SEQUENCE 1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 36779720 - 36784887 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131021415 |
|---|---|
| GeneID | 131021415 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021415 |
| 原始查询 | SmilChr04G002270 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein FAR1-RELATED SEQUENCE 1-like |
| 产物 | protein FAR1-RELATED SEQUENCE 1-like |
| Arabidopsis | AT4G38180 (FRS5)FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=39.2; qcov=0.499; evalue=7.07e-46; confidence=medium |
| Rice | Os07g0563600 (OJ1720_F04.111)- identity=39; qcov=0.637; evalue=3.5e-60; confidence=medium |
| GO | GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF04434 (SWIM) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021415 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057806584.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057806584.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057806584.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057806584.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057806584.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057806584.1PF04434
SWIM 155-183 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057806584.1 |
Pfam | PF04434 |
SWIM | Domain | 155 | 183 | 5.1e-08 | 33.0 | SWIM zinc finger |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。