当前解析结果
SmilChr04G002271| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002271 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002271 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G002271 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 36826315 - 36826833 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023381 |
|---|---|
| GeneID | 131023381 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023381 |
| 原始查询 | SmilChr04G002271 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT3G31430 (AT3G31430)zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822909] identity=31.2; qcov=0.82; evalue=4.16e-09; confidence=low |
| Rice | Os12g0156200- identity=30.8; qcov=0.773; evalue=6.63e-15; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF14111 (DUF4283) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023381 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057808902.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057808902.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057808902.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808902.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808902.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057808902.1PF14111
DUF4283 42-122 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057808902.1 |
Pfam | PF14111 |
DUF4283 | Domain | 42 | 122 | 2.3e-16 | 60.0 | Domain of unknown function (DUF4283) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。